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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】ZINC数据库
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ZINC数据库

最近发现Zinc数据库有些分子的三维结构，从里面找到了要的分子结构做COMFA，导入SYBYL后，依然从优化做起

          请问，Zinc里的数据是晶体结构么

           它里面给的三维结构，是如何得来的？
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1楼 2010-03-30 10:55:59
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arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-30 12:48
绿茶QJM(金币+1): 2010-03-30 14:39
分子结构假如有晶体报道的就用有报道的，没晶体就自己画一个优化一下。
ZINC的不是
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2楼2010-03-30 11:56:53
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)
哦，谢谢，那docking为什么直接可以用虚拟筛选呢？
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3楼2010-03-30 14:39:46
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)
那ZINC数据库里，所给的晶体数据库是如何得来的呢？

是它也经过一些优化么
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4楼2010-03-30 14:50:14
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arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-03-30 17:44
绿茶QJM(金币+1): 2010-03-31 09:16
不是所有化合物都会拿去结单晶的……对接不等于就是用晶体结构
你下载完了，自己优化一下，假如你觉得不缺时间，可以做柔性对接。
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5楼2010-03-30 17:21:16
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