24小时热门版块排行榜    

查看: 998  |  回复: 14
当前主题已经存档。

wtscrystal

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】ADF问题请教!

我用ADF优化结构
#! /bin/sh

# ==============================
# The Molecule
# ==============================

"$ADFBIN/adf" < ATOMS
1 xx      -1.770410000000      -3.066430000000      -4.964340000000   b=M51Vfinal
2 xx      -3.078970000000      -5.332940000000      -2.728710000000   b=M51Vfinal


378 281 285 1.0
END

CHARGE -21

UNRESTRICTED

BASIS
type DZ
core Large
createoutput None
END

XC
LDA SCF VWN
END

GEOMETRY
    optim Delocalized
END

SAVE  TAPE21 TAPE13

SCF
iterations 500
END

NOPRINT LOGFILE

eor


####################################################
最后出现以下结果:
<13:11:30>  cart. step rms                      0.00370285     0.00666667    T
Coordinates in Geometry Cycle 30
..................................
<13:23:04>    2  ErrMat   0.02700647  MaxEl  0.00139724
<13:23:32>    3  ErrMat   0.02097968  MaxEl  0.00081368
<13:24:01>    4  ErrMat   0.08667922  MaxEl -0.00441872
<13:24:27>    5  ErrMat   0.01938159  MaxEl -0.00076675
<13:24:50>    6  ErrMat   0.01986987  MaxEl  0.00155846
<13:25:11>    7  ErrMat   0.01017430  MaxEl -0.00099106
<13:25:27>    8  ErrMat   0.00705066  MaxEl  0.00070761
<13:25:42>    9  ErrMat   0.00354366  MaxEl -0.00021697
<13:25:58>   10  ErrMat   0.00172884  MaxEl -0.00006357
<13:26:13>   11  ErrMat   0.00078621  MaxEl -0.00003336
<13:26:15>  SCF converged
<13:26:29>   12  ErrMat   0.00046677  MaxEl  0.00002342
<13:26:39>  >>>> TOTEN
<13:27:26>  >>>> POPAN
<13:27:34>  >>>> DEBYE
<13:27:48>  >>>> AMETS
<13:29:17>  >>>> ENGRAD
<13:47:11>  current energy                              -74.30022571 Hartree
<13:47:11>  abs of energy change                0.00187059     0.00100000    F
<13:47:11>  constrained gradient max            0.02527662     0.00100000    F
<13:47:11>  constrained gradient rms            0.00217207     0.00066667    F
<13:47:11>  gradient max                        0.02527662
<13:47:11>  gradient rms                        0.00217207
<13:47:11>  cart. step max                      0.03342936     0.01000000    F
<13:47:11>  cart. step rms                      0.00842956     0.00666667    F
<13:47:11>  ERROR: GEOMETRY DID NOT CONVERGE
<13:47:13>  NORMAL TERMINATION
<13:47:23>  END
Job v9 has finished

请问: SCF 收敛,但报错说: ERROR: GEOMETRY DID NOT CONVERGE
这是为何,是轮数不够,我用的30轮。
而发现结构中的一个二甲基胺发生了变形,如下图所示:



有何高招没有,各位仁兄!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-03-31 09:17
显然是在你的30 Geometry Cycle后,没有满足收敛条件. 或者增多步数, 或者减弱收敛要求.
Life, Love, Laugh.
2楼2010-03-29 08:46:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtscrystal

银虫 (小有名气)

也就是说只是时间不够,或步数不够并不是因为别的什么原因???
3楼2010-03-29 12:00:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

random789

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-03-31 09:17
你用最后一圈不收敛的集合结构代入输入文件中重算,顺便把几何优化的圈数扩大
好好学习,天天向上!
4楼2010-03-29 14:49:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-03-31 09:17
你最后一圈的收敛都是F,显然你建的模型很不合理,加大圈数也没多大作用,重新调整模型吧
5楼2010-03-29 15:08:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

九仙居士

捐助贵宾 (正式写手)

先检查下你的初始结构
6楼2010-03-29 15:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtscrystal

银虫 (小有名气)

我的结构是用X-ray得到的,不知如何调是好?
7楼2010-03-29 21:59:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtscrystal

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by random789 at 2010-03-29 14:49:41:
你用最后一圈不收敛的集合结构代入输入文件中重算,顺便把几何优化的圈数扩大

大哥, ADF例子中是这样的:


他的那些个后面也是F,这是为何?
请问: 这里要全为T,还是有个别为T即可?
而且图中还是Geometry Convergence!

[ Last edited by wtscrystal on 2010-3-30 at 18:42 ]
8楼2010-03-30 16:52:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-04-01 09:15
引用回帖:
Originally posted by wtscrystal at 2010-03-30 16:52:30:
他的那些个后面也是F,这是为何?
请问: 这里要全为T,还是有个别为T即可?
而且图中还是Geometry  ...

应该全为T才合理,再频率计算无虚频才能说你得到的构型合理。
看结果先看logfile
9楼2010-03-31 11:52:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sculhf

荣誉版主 (知名作家)

断翼天使

优秀版主优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-04-01 09:16
出错的原因很多(不要忘记先预优化)
你也可以降低一下优化收敛的标准(不推荐,你是按默认计算的)换一下构型
或者换台电脑再计算一遍
谋事在人成事在天
10楼2010-03-31 17:11:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wtscrystal 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +16 低垂的野花 2026-07-31 22/1100 2026-08-01 16:39 by Cathyau
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 9/450 2026-08-01 15:50 by y4XuShGyllvT
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 6/300 2026-08-01 15:46 by y4XuShGyllvT
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 11/550 2026-08-01 15:43 by y4XuShGyllvT
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 11/550 2026-08-01 15:43 by y4XuShGyllvT
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 11/550 2026-08-01 15:40 by y4XuShGyllvT
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +15 布布和一二 2026-07-30 19/950 2026-08-01 15:18 by 40862026
[基金申请] 微信指数没变化,科研之友没阅读 +14 wangze12014 2026-07-28 18/900 2026-07-31 18:35 by lzchaihuo
[教师之家] 基础研究怎么拉横向,学校到款任务越来越多,难以完成 拉横向,都有哪些途径啊 +8 锦衣卫寒战 2026-07-28 8/400 2026-07-31 18:13 by beefly
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液,是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 系统今天又提示维护了,估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[考博] 申请2027年材料/化学类博士 10+3 考研老狗? 2026-07-25 5/250 2026-07-30 19:33 by 白色木鱼
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[基金申请] 今年的WR进展到哪一步了? +5 wsgjhwz 2026-07-25 9/450 2026-07-30 12:59 by 可淡不可忘
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
[基金申请] 时间戳他又来了 +14 晓晓爱翠翠 2026-07-26 17/850 2026-07-29 16:30 by 呵呵二哥
[有机交流] 这个自发加氧反应的机理是什么? 50+4 YUAN2273 2026-07-25 7/350 2026-07-29 12:27 by xiaobenpu
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 11/550 2026-07-29 05:50 by drbart
[基金申请] 同事接到电话了,我却没有 +4 1234567wang 2026-07-27 4/200 2026-07-28 10:11 by GOODLUCKER
[基金申请] 准备明年的基金了 +5 Tide man 2026-07-27 5/250 2026-07-28 09:25 by newfuzzy1
信息提示
请填处理意见