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wdgsmv58

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】荧光定量PCR数据分析 ???

纠结中.........
前期本人做了一批荧光定量,实验是这样设计的:
样品为植物叶片组织,接种某一病毒,
设抗感对照,
按接种后0h,2h,4h,8h,12,24h取样,
各个时间点设病毒组和对照组(接不含病毒的缓冲液)。


结果每个基因在各个时间点就有4幅柱状图:
抗病的病毒组和对照组,感病的病毒组和对照组。


本实验的目的是比较某个基因在抗感品种中是否有差异,
同时剔除缓冲液的干扰。

如此则存在这样的问题:
如何剔除缓冲液的影响?是各个时间点的病毒组减去对照组还是除以对照组?
亦或是直接去比较?
如果减的话,0h对照如何处理?还有减或除后误差如何控制?
如果病毒组和对照组直接比较,还需要跟0h相比吗?
这样的比较后,如何分析抗感之间的比较??


看过一些文献,正规的实验应该这样设计的,也有不少文献也提到这样设计的,
不过他们在分析的时候并没有详细的描述分析过程,
至今上面的问题仍然在我的脑海中纠结中,
不知道怎么样分析才好,
望有经验的大虾们给予指导,
谢谢!!!




本贴设置的金币奖励一直无合适的人给予解答,
现想收回金币,取消求助,可否?
谢谢!

[ Last edited by wdgsmv58 on 2010-6-11 at 08:07 ]
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海纳百川,有容乃大!壁立千仞,无欲则刚!
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

wdgsmv58(金币+2):谢谢!! 2010-03-28 09:45
==b
看了半天,其实能不能画个简图来表达一下呢?我还不大理解你怎么设计的实验
这么多组肯定是方差分析+LSD-t之类的了(前提是符合正态分布)
把缓冲液作为一个因素来看的话,当然不是剔除或者减去那么简单啦~肯定要单独作为一组数据来对待
9楼2010-03-26 21:53:18
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wdgsmv58

铁杆木虫 (正式写手)



我的求助要沉下去了,
各位大虾怎么不给出一个建议呢???
即使不是专业的,
只能您给出一定的建议
都有金币赠送哦,
而且现在我已经增加了金币的个数
望各位大虾献言献策
海纳百川,有容乃大!壁立千仞,无欲则刚!
2楼2010-03-26 10:48:21
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主


1949stone(金币+1): 2010-03-26 12:56
wdgsmv58(金币+2):不知阁下做过类似的实验没有?欢迎有时间交流交流 2010-03-26 17:13
oh就是直接提rna啊,缓冲液对照,你随便吧,2h也行,2-24都设也行
3楼2010-03-26 11:31:01
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wdgsmv58

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by silicare at 2010-03-26 11:31:01:
oh就是直接提rna啊,缓冲液对照,你随便吧,2h也行,2-24都设也行

呵呵,
我上面提到的实验已经完成,
所有的样品都提RNA做过荧光定量分析,
所有的数据也都出来了,
实验设计的也基本合理,
现在纠结的是结果数据如何去比较分析?
海纳百川,有容乃大!壁立千仞,无欲则刚!
4楼2010-03-26 17:11:45
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