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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

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[交流] 【分享】转换Gaussian 09的output为Gaussian 03的格式

众所周知，Gaussian 09的输出格式和03格式有些不同，因此，原来能够正确读取03的output的可视化软件在读取09的output是会出现问题，下面这个脚本可以将09的格式转化为03的格式，从而能够被可视化软件正确读取。

#!/bin/bash
if [ "$#" -eq 0 ]; then echo -e "2010 by Lorenz Blum\nMakes gaussian09 output readable by molekel5.4\nUsage: $0 input output";exit;fi

#Gaussian 03: Otherwise it guesses it a Gaussian 94 outputfile, Density Matrix: To recognize the density matrix, Eigenvalues: To visualize the MOs, Atom AN: To see spectra
cat $1 | sed "s/Gaussian 09/Gaussian 03/" | sed "s/Eigenvalues -- /EIGENVALUES -- /" | sed "s/Density Matrix:/DENSITY MATRIX./" | sed "s/ Atom AN/Atom AN/" > $

这个脚本可以在Molekel的主页上下载：http://molekel.cscs.ch/wiki/pmwiki.php/Main/DownloadBinary

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1楼2010-03-24 21:58:10

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pwzhou

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其实上面这个脚本很简单的，就是用sed进行简单的查找替换而已，Gaussian 09和03的差别在于：
   Gaussian 09          Gaussian 03
1. “Gaussian 09”          “Gaussian 03”
2. “Eigenvalues -- ”    “EIGENVALUES -- ”
3. “Density Matrix:”    “DENSITY MATRIX.”
4. “ Atom  AN”             “Atom AN”

可以看出，除了第一点不同之外，其他的其实完全没必要更改。

引用回帖:

Originally posted by lihb734 at 2010-03-25 07:53:48:
高手们，能否根据这个脚本解释一下G09和G03结果文件的差异子在哪了？
我们不会编程啊。
谢谢！