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【求助/交流】高通量筛选
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chengkun
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【求助/交流】高通量筛选
各位高手,最近我要用96孔板作高通量筛选。具体的情况是:我用枯草芽孢杆菌构建蛋白酶的突变文库,筛选时用96孔板,底物选一种合成的复合底物AAPF。具体做时,遇到了一些问题,如底物的使用浓度,反应时间等。其中我最迷惑不解的是如何确定底物AAPF的使用浓度,那位高手能够指点一下,谢谢了。急!
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2010-03-24 14:25:36
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):给个红包,谢谢回帖交流
Kd是解离常数,数值上等于平衡常数的倒数
对于最简单的单位点结合,P+L-----PL
Kd=[P]*[L]/[PL],运用质量守恒可得θ=[L]/(Kd+[L]),L是配体浓度,θ是饱和分数。如果有n个结合位点,就要拟合两个参数n 和Kd。具体看看书吧,公式自己推一下。得到的实验数据可用oringe or sigmaplot拟合
还有可以考虑做ITC,可以单次实验得到n和Kd
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2010-03-25 09:32:12
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amisking(金币+1): 2010-03-24 18:15
底物选择在0.2--5Km 即可
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2楼
2010-03-24 17:21:39
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那再请教个问题,是否需要做一个预备试验,检测一下不同底物浓度下的酶反应速度与时间的关系曲线?每个浓度会各有一条曲线,那究竟该选哪个浓度呢?
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2010-03-24 17:34:21
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amisking(金币+2): 2010-03-24 18:16
底物浓度选择在上述范围内,当底物浓度饱和时即可达到最大反应速率,拉底物梯度,可拟合得到Km和V
如果仅为了进行高通量筛选,可选择10倍Km作为底物浓度。
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2010-03-24 18:11:14
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