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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】求助大侠，你们的回答对我很重要。
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woney

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求助大侠，你们的回答对我很重要。 已有2人参与

大侠们，
     我的课题是研究酶分子与金属离子的相互作用。从动力学上研究之后，想从分子模拟角度看看酶与金属离子的可能作用。
     之前对分子模拟这块一窍不通。我想请教一下，这块研究是否可行，难度有多大。如果可行的话，那么会用到哪些软件，是否有有用的指导书。
     承蒙各位赐教！！！
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1楼 2010-03-23 16:03:36
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gc19861208

铁杆木虫 (职业作家)
ghcacj(金币+1):本版谢绝任何形式的纯粹顶贴，扣你1个金币，修改后归还 2010-03-23 21:03
ghcacj(金币-2):操作失误，还是扣除1个金币 2010-03-23 21:05
ghcacj(金币+1):金币归还 2010-03-24 10:08
不大清楚，祝福一下吧。

[ Last edited by gc19861208 on 2010-3-23 at 21:06 ]
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2楼2010-03-23 20:14:26
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daizi454550
3楼2010-03-23 22:33:03
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cy2003

新虫 (初入文坛)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-30 10:05:32
我用的也是DS，多肽和金属离子相互作用

不过我这里的DS只有MD模块的lisence，没有QM，经典力场的原理，只涉及静电力、范德华力等非键作用，而不涉及与电子性质有关的性质。

我也是菜鸟啊，我觉得如果lz你要研究金属离子性质的话，至少要用到QM吧……仅是菜鸟建议
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4楼2010-05-30 09:48:26
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wujiangjie

木虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-31 09:22:35
我个人觉得应该用QM算，我之前研究DNA与金属离子相互作用就是用的QM，用Dmol模块，可以模拟
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5楼2010-05-31 09:12:56
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