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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】有没有同学有在ITS区设计引物做PCR的文章？
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【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 leon198418029 的 4 个金币

leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate

[交流] 【求助/交流】有没有同学有在ITS区设计引物做PCR的文章？

如题，现在要设计引物，但是ITS区虽然变异大，适合属下种间的区分，但是引物设计较难。求此方面文章作参考，不胜感激。
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不忘初心，为梦远行。
1楼 2010-03-22 11:44:24
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won7

金虫 (小有名气)
★ ★
amisking(金币+2): 2010-03-22 19:05
为什么不在18S，5.8S和28S序列里设计引物呢？这些区域有很保守的序列。
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2楼2010-03-22 14:31:31
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leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate
引用回帖:
Originally posted by won7 at 2010-03-22 14:31:31:
为什么不在18S，5.8S和28S序列里设计引物呢？这些区域有很保守的序列。

可是这些序列在属下种间相当保守啊，我要做的就是把属下种间的生物分开，ITS不是较好的区域码？
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不忘初心，为梦远行。
3楼2010-03-22 15:46:50
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
1949stone(金币+1): 2010-03-22 16:11
[15]White T，Bruns T，Lee S ,et al.Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics．PCR protocols:a guide to methods and applications. Academic, New York, 1990.315-322.
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2010-03-22 16:06:55
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won7

金虫 (小有名气)
leon198418029(金币+1): 2010-03-22 18:38
引用回帖:
Originally posted by leon198418029 at 2010-03-22 15:46:50:

可是这些序列在属下种间相当保守啊，我要做的就是把属下种间的生物分开，ITS不是较好的区域码？

我的意思在18S，5.8S和28S序列里设计引物，扩增ITS，ITS就是夹在它们中间啊。
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5楼2010-03-22 18:06:18
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leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate
引用回帖:
Originally posted by won7 at 2010-03-22 18:06:18:


我的意思在18S，5.8S和28S序列里设计引物，扩增ITS，ITS就是夹在它们中间啊。

对，这样可行。我是做定量的，不用测序，按照你这个说法，再加上属内种间的18S,5.8S,28S相似性很高而ITS区较低，我可以将引物设计在以上三个区域，而将探针设计在ITS区对吧？
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不忘初心，为梦远行。
6楼2010-03-22 18:38:01
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