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【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 leon198418029 的 4 个金币

leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate

[交流] 【求助/交流】有没有同学有在ITS区设计引物做PCR的文章?

如题,现在要设计引物,但是ITS区虽然变异大,适合属下种间的区分,但是引物设计较难。求此方面文章作参考,不胜感激。
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不忘初心,为梦远行。
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won7

金虫 (小有名气)

★ ★
amisking(金币+2): 2010-03-22 19:05
为什么不在18S,5.8S和28S序列里设计引物呢?这些区域有很保守的序列。
2楼2010-03-22 14:31:31
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leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate

引用回帖:
Originally posted by won7 at 2010-03-22 14:31:31:
为什么不在18S,5.8S和28S序列里设计引物呢?这些区域有很保守的序列。

可是这些序列在属下种间相当保守啊,我要做的就是把属下种间的生物分开,ITS不是较好的区域码?
不忘初心,为梦远行。
3楼2010-03-22 15:46:50
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶


1949stone(金币+1): 2010-03-22 16:11
[15]White T,Bruns T,Lee S ,et al.Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics.PCR protocols:a guide to methods and applications. Academic, New York, 1990.315-322.
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2010-03-22 16:06:55
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won7

金虫 (小有名气)

leon198418029(金币+1): 2010-03-22 18:38
引用回帖:
Originally posted by leon198418029 at 2010-03-22 15:46:50:

可是这些序列在属下种间相当保守啊,我要做的就是把属下种间的生物分开,ITS不是较好的区域码?

我的意思在18S,5.8S和28S序列里设计引物,扩增ITS,ITS就是夹在它们中间啊。
5楼2010-03-22 18:06:18
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leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate

引用回帖:
Originally posted by won7 at 2010-03-22 18:06:18:


我的意思在18S,5.8S和28S序列里设计引物,扩增ITS,ITS就是夹在它们中间啊。

对,这样可行。我是做定量的,不用测序,按照你这个说法,再加上属内种间的18S,5.8S,28S相似性很高而ITS区较低,我可以将引物设计在以上三个区域,而将探针设计在ITS区对吧?
不忘初心,为梦远行。
6楼2010-03-22 18:38:01
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