| 查看: 489 | 回复: 2 | ||
| 当前主题已经存档。 | ||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 wdzst 的 20 个金币 | ||
[交流]
【求助】GOLD支持的原子类型和键型有哪些
|
||
| 请问使用GOLD做对接，配体小分子的原子类型和键型有哪些？谢谢！ |
回复此楼
★ ★ ★
wdzst(金币+30):原来手册里面就有，不过还是谢谢了！ 2010-03-18 17:46
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-03-18 17:56
wdzst(金币+30):原来手册里面就有，不过还是谢谢了！ 2010-03-18 17:46
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-03-18 17:56
|
GOLD与Sybyl是一样的 原子类型： Hydrogen H Carbon sp3 C.3 Carbon sp2 C.2 Carbon sp C.1 Carbon aromatic C.ar Carbocation (guanadinium) C.cat Nitrogen sp3 N.3 Nitrogen sp2 N.2 Nitrogen sp N.1 Nitrogen aromatic, e.g. in pyridine N.ar Nitrogen amide N.am Nitrogen trigonal planar, e.g. in nitro, pyrrole N.pl3 Nitrogen sp3 positively charged, e.g. in lysine N.4 Oxygen sp3 O.3 Oxygen sp2 O.2 Oxygen in carboxylates and phosphates O.co2 Sulphur sp3 S.3 Sulphur sp2 S.2 Sulphoxide sulphur S.o Sulphone sulphur S.o2 Phosphorus sp3 P.3 Halogens, metals normal element symbols, e.g. F, Cl, Ca, Zn 键型： single 1 double 2 triple 3 aromatic ar amide am delocalised, e.g. in carboxylate, guanidinium ar |
2楼2010-03-18 17:40:29
mollyzhang
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 10375.6
- 散金: 350
- 红花: 4
- 帖子: 2490
- 在线: 417.5小时
- 虫号: 53071
- 注册: 2004-09-12
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
3楼2010-03-20 11:42:12