24小时热门版块排行榜

返回列表

当前主题已经存档。

zyj8119

木虫 (著名写手)

应助: 65 (初中生)
贵宾: 0.003
金币: 915.1
散金: 1440
红花: 35
帖子: 2936
在线: 1329.4小时
虫号: 664177
注册: 2008-11-29
性别: GG
专业: 理论和计算化学

[交流] 【求助】FORTRAN编程添加原子已有1人参与

【求助】在MS导出的文件中，按照规则添加原子

上个帖子我说了，可以把晶体结构保存为PDB格式，比如说，我要在一个沸石结构上表面添加氨基，那么像这样的程序为什么运行不出来？
OPEN(10,FILE="MFI.PDB",POSITION="ASIS",ACTION="READWRITE",STATUS="OLD"

OPEN(60,FILE="MFINEW.PDB",STATUS="REPLACE"

READ(10,"(A80)"

ATOMNUM,XXX,YYY,ZZZ
C    %计算新加入的第一个原子与原来骨架距离%
         DO  XXX=1,7776,1
      DO  YYY=1,7776,1
      DO  ZZZ=1,7776,1
         CALL RAND(XNEW)
         CALL RAND(YNEW)
         CALL RAND(ZNEW)
20          IF SQRT(((XNEW-XXX)**2+(YNEW-YYY)**2+(ZNEW-ZZZ)**2).LT.0.05)
         THEN
            WRITE(20,“(4A7)"

ATOMNUM,XXNEW,YYNEW,ZZNEW
            ELSE
         END IF
      END DO
      END DO
      END DO
C    %计算新加入的第二个原子与原来骨架距离%
      DO  XXX=1,7777,1
      DO  YYY=1,7777,1
      DO  ZZZ=1,7777,1
         CALL RAND(XXNEW)
         CALL RAND(YYNEW)
         CALL RAND(ZZNEW)
30          IF SQRT(((XXNEW-XXX)**2+(YYNEW-YYY)**2+(ZZNEW-ZZZ)**2).LT.0.05)
         THEN
            WRITE(30,“(4A7)"

ATOMNUM,XXNEW,YYNEW,ZZNEW
            ELSE
         END IF
      END DO
      END DO
      END DO
C    %计算新加入的第三个原子与原来骨架距离%
      DO  XXX=1,7778,1
      DO  YYY=1,7778,1
      DO  ZZZ=1,7778,1
         CALL RAND(XXXNEW)
         CALL RAND(YYYNEW)
         CALL RAND(ZZZNEW)
40       IF SQRT(((XXXNEW-XXX)**2+(YYYNEW-YYY)**2+(ZZZNEW-ZZZ)**2).LT.0.0
      5 )THEN
      WRITE(40,“(4A7)"

ATOMNUM,XNEW,YNEW,ZNEW
      ELSE
      END IF
      END DO
      END DO
      END DO
   WRITE(60,“(10A7)"

ATOMNUM,XNEW,YNEW,ZNEW,XXNEW,YYNEW,ZZNEW,XXXNE
      W,YYNEW,ZZNEW,XXXNEW,YYYNEW,ZZZNEW
   END

            SUBROUTINE RAND(M)
      DOUBLE PRECISION S,U,V,R
      S=65536.0
      U=2053.0
      V=13849.0
      M=R/S
      R=R-M*S
      R=U*R+V
      M=R/S
      R=R-M*S
      NRND1=R/S
      RETURN
      END
我的思想是读入文件，然后再骨架中，引用随机数，随即的插入原子，只有当心加入的原子与原来原子的距离小于0.05的时候，才认为成键了，不知道这样的做法对不对？在FORTRAN编译器中，读入文件，对文件操作需要把文件和程序放在一个文件夹里面。

回复此楼

» 猜你喜欢

请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。已经有4人回复
真诚求助：手里的省社科项目结项要求主持人一篇中文核心，有什么渠道能发核心吗已经有6人回复
孩子确诊有中度注意力缺陷已经有14人回复
三甲基碘化亚砜的氧化反应已经有4人回复
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢已经有5人回复
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗已经有5人回复
2025冷门绝学什么时候出结果已经有3人回复
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入已经有4人回复
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生已经有6人回复
AI论文写作工具：是科研加速器还是学术作弊器？已经有3人回复

好好学习，天天向上。

1楼2010-03-17 13:51:53

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zyj8119

木虫 (著名写手)

应助: 65 (初中生)
贵宾: 0.003
金币: 915.1
散金: 1440
红花: 35
帖子: 2936
在线: 1329.4小时
虫号: 664177
注册: 2008-11-29
性别: GG
专业: 理论和计算化学

PROGRAM MAIN
INTEGER INUM,JNUM,KNUM
REAL XNEW,YNEW,ZNEW,XXNEW,YYNEW,ZZNEW,XXXNEW,YYYNEW,ZZZNEW,XXX,
&YYY,ZZZ
OPEN(10,FILE="MFI.PDB",STATUS="OLD"

OPEN(20,FILE="MFI2.PDB",STATUS="NEW"

OPEN(30,FILE="MFI3.PDB",STATUS="NEW"

OPEN(40,FILE="MFI4.PDB",STATUS="NEW"

READ(10,*)INUM,XXX,YYY,ZZZ
   DO  INUM=1,7776
   XNEW=RAN0(INUM)
   YNEW=RAN0(INUM)
   ZNEW=RAN0(INUM)
   O=SQRT((XNEW-XXX)**2+(YNEW-YYY)**2+(ZNEW-ZZZ)**2)
   IF ((O.LE.1.51).AND.(O.GT.0))THEN
WRITE(20,*)INUM,XNEW,YNEW,ZNEW
ELSE
WRITE(20,*)'ERROR'
   END IF
END DO
DO  JNUM=1,INUM
   XXNEW=RAN0(JNUM)
   YYNEW=RAN0(JNUM)
   ZZNEW=RAN0(JNUM)
   P=SQRT((XXNEW-XNEW)**2+(YYNEW-YNEW)**2+(ZZNEW-ZNEW)**2)
   IF ((P.LE.1.51).AND.(P.GT.0))THEN
WRITE(30,*)JNUM,XXNEW,YYNEW,ZZNEW
ELSE
   WRITE(30,*)'ERROR'
   END IF
END DO
   DO  KNUM=1,JNUM
   XXXNEW=RAN0(KNUM)
   YYYNEW=RAN0(KNUM)
   ZZZNEW=RAN0(KNUM)
Q=SQRT((XXXNEW-XXNEW)**2+(YYYNEW-YYNEW)**2+(ZZZNEW-ZZNEW)**2)
IF ((Q.LE.1.51).AND.(Q.GT.0))THEN
   WRITE(40,*)KNUM,XXXNEW,YYYNEW,ZZZNEW
   ELSE
   WRITE(40,*)'ERROR'
   END IF
END DO
END

   FUNCTION RAN0(IDUM)
INTEGER IDUM,IA,IM,IQ,IR,MASK
REAL RAN0,AM
PARAMETER(IA=16807,IM=2147483647,AM=1./IM,
   &IQ=127773,IR=2836,MASK=123459876)
   INTEGER K
IDUM=IEOR(IDUM,MASK)
K=IDUM/IQ
IDUM=IA*(IDUM-K*IQ)-IR*K
IF(IDUM<0)IDUM=IDUM+IM
RAN0=AM*IDUM
IDUM=IEOR(IDUM,MASK)
END

这样的话，编译能通过了，但是不知道为什么运行不出来？我就是在MFI.PDB这个文件中，随机插入一些原子，首先插入第一种，然后插入第二种，。。。