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【求助】ms的建模与其他的软件联用
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| 我们在使用LINUX源代码软件的时候，经常会出现构型文件难以得到的问题，MS建立的结构能保存为PDB格式，而这个PDB格式又能用写字板打开，但是比如说建立一个分子筛的结构，想在表面加上氨基，在PDB文件里面操作，VISUAL FORTRAN不是有个功能是操作文件吗？各位有做过的吗、 |
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saitou
木虫 (正式写手)
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2楼2010-03-17 11:51:04
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但是PDB文件的格式是这样的啊： REMARK Materials Studio PDB file REMARK Created: Tue Mar 16 19:19:12 Pacific Standard Time 2010 CRYST1 27.011 27.011 18.021 90.00 90.00 120.00 P1 ATOM 1 Zn1 MOL 2 15.619 -6.102 7.438 1.00 0.06 Zn ATOM 2 C7A MOL 2 17.378 -4.465 9.134 0.70 0.17 C ATOM 3 H7A MOL 2 16.535 -4.272 9.787 0.70 0.20 H ATOM 4 N1 MOL 2 17.330 -5.287 8.068 1.00 0.09 N ATOM 5 O4 MOL 2 18.588 -7.395 6.695 0.30 0.09 O ATOM 6 C1 MOL 2 15.542 -7.958 5.194 1.00 0.16 C ATOM 7 H1 MOL 2 15.267 -8.784 5.832 1.00 0.19 H ATOM 8 N2 MOL 2 15.750 -6.700 5.633 1.00 0.10 N ATOM 9 O1 MOL 2 16.173 -3.896 5.629 1.00 0.11 O ATOM 10 O8 MOL 2 10.814 -6.048 6.620 0.44 0.10 O ATOM 11 N3 MOL 2 14.120 -4.843 7.632 1.00 0.07 N ATOM 12 C6A MOL 2 14.326 -3.568 8.009 0.56 0.09 C ATOM 13 H6A MOL 2 15.304 -3.113 8.106 0.56 0.11 H ATOM 14 C3 MOL 2 16.163 -8.638 8.674 1.00 0.10 C ATOM 15 H3 MOL 2 17.188 -8.586 8.342 1.00 0.12 H ATOM 16 N4 MOL 2 15.260 -7.670 8.469 1.00 0.07 N 而FORTRAN 编译器只能从第一个光标开始读啊。 |
3楼2010-03-17 12:01:35
4楼2010-03-17 14:04:34
5楼2010-03-18 14:01:54
6楼2010-03-19 00:48:35
acridine
木虫 (正式写手)
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- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
7楼2010-03-19 01:49:26