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铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】连接后的问题

我将一个1500bp的片段连接到载体中,做菌落PCR有目的片段,大小也合适,但是提取质粒酶切验证只有1200bp,再做PCR也P不出来了。用下游引物测序后进行比对也是需要的片段。这到底是怎么回事啊?会不会我只是转进去一部分,可是用的是双酶切啊!请教大家!
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼上有理,测通比对下吧。
Thank-you,so-blue.
4楼2010-03-16 15:04:31
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主

★ ★ ★ ★
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amisking(金币+3): 2010-03-16 12:33
怎么不测通啊!
   觉得是有点奇怪,会不会是插入片段发生突变,正好产生了一个同上游片段相同的酶切位点,但是质粒pcr出不来有不好解释。转进去一部分,但是菌落pcr 能扩增出1500bp的片段又不好解释。
   测通序列比对一下再说吧
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
2楼2010-03-16 10:28:14
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song333

金虫 (小有名气)

★ ★
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1949stone(金币+1): 2010-03-16 12:12
possibly there is an internal restriction site at 0.3 kb from one end.

that explains why you can't get the PCR fragment after digestion.
3楼2010-03-16 10:43:47
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