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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】如何跨内含子设计引物(只有mRNA)

我现在克隆获得了对虾的某个基因的全序列,想设计taqman探针和引物,进行RT real-time PCR对mRNA进行定量,听说需要跨内含子设计引物,但是对虾是没有进行全基因组测序的,相关生物也没有,我如何能查到内含子?或者如何知道内含子的位点?请高手指教,谢谢!
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cascc

铜虫 (小有名气)

其实就是你设计一对引物,扩下基因组DNA,之后呢在用这个引物扩下mRNA。这样两个条带如果有差异就是内含子啊,可以测序比对就找到了内含子的序列和位置了。
7楼2010-03-17 20:41:09
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song333

金虫 (小有名气)

★ ★
amisking(金币+2): 2010-03-16 12:34
yujiaping1(金币+2):就是消化掉DNA就可以了吗?control怎么回事?英语不太好,没看懂 2010-03-16 13:13
if you set a control to rule out the contamination of genomic DNA, it not necessary to design primers spanning intron.
2楼2010-03-16 10:27:29
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434744419

金虫 (小有名气)

yujiaping1(金币+1):不是不明白control,是说你做什么control,没懂 2010-03-16 19:39
control 是对照  看来外文资料看的太多啊 !
3楼2010-03-16 17:23:36
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434744419

金虫 (小有名气)

yujiaping1(金币+1): 2010-03-16 19:38
用试剂盒提RNA就可以啊 !里面有酶可以去除DNA
4楼2010-03-16 17:35:21
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