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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】如何跨内含子设计引物(只有mRNA)

我现在克隆获得了对虾的某个基因的全序列,想设计taqman探针和引物,进行RT real-time PCR对mRNA进行定量,听说需要跨内含子设计引物,但是对虾是没有进行全基因组测序的,相关生物也没有,我如何能查到内含子?或者如何知道内含子的位点?请高手指教,谢谢!
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song333

金虫 (小有名气)

yujiaping1(金币+1):谢谢,明白了 2010-03-17 11:08
about control:

the same sample you can divide it into two parts: one treat with reverse transcriptase, one treat without transcriptase, then do PCR side by side.  

If the sample without transcriptase treatment has the positive band, you got genomic DNA contamination.  If not, you are in good shape.
6楼2010-03-17 10:58:08
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song333

金虫 (小有名气)

★ ★
amisking(金币+2): 2010-03-16 12:34
yujiaping1(金币+2):就是消化掉DNA就可以了吗?control怎么回事?英语不太好,没看懂 2010-03-16 13:13
if you set a control to rule out the contamination of genomic DNA, it not necessary to design primers spanning intron.
2楼2010-03-16 10:27:29
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434744419

金虫 (小有名气)

yujiaping1(金币+1):不是不明白control,是说你做什么control,没懂 2010-03-16 19:39
control 是对照  看来外文资料看的太多啊 !
3楼2010-03-16 17:23:36
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434744419

金虫 (小有名气)

yujiaping1(金币+1): 2010-03-16 19:38
用试剂盒提RNA就可以啊 !里面有酶可以去除DNA
4楼2010-03-16 17:35:21
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