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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】应用MS计算径向分布函数
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lifei2008

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】应用MS计算径向分布函数 已有3人参与

我想用MS的discover模块中的analysis计算水的pair correlation function（也叫做径向分布函数），可是对话框中analyze按钮为非激活状态，无法计算。问题可能出现在choose sets选项上，因为其下拉列表中是空白的，我无法进行选择。可是我不知道如何能够解决这个问题。敬请各位高手帮帮忙啦！
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生命不息，奋斗不止！
1楼 2010-03-15 12:09:23
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红精灵

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by 点点儿 at 2010-05-06 15:10:03:
你是说用Edit-Find Patterns 找么？
我这样Find 之后，Edit Sets，分析径向分布函数的时候，Choose Sets下拉框中是空白的

你好！我也遇到了跟你之前一样的问题。
我选择了体系中的某个分子做SET时，用Forcite/analysis/RDF分析时，choose site 选择这个SET之后，点击Analysis出现如下结果：
Analysis failed
There are not enough atoms for a RDF. Need at least two atoms.
这如何解决呢？
如果我想在体系中选择一个原子基团（比如想选择CH3-），该如何操作呢?
谨请大侠赐教
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

hellolong
飞刀
13楼2011-06-29 11:39:35
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
lifei2008(金币+5): 2010-03-15 14:09
ice_rain(金币+2):谢谢指导 2010-03-15 22:16
lifei2008(金币+10): 2010-03-22 08:49
EDIT->ATOM SELECTION,选择好整个水分子，然后还是EDIT里面的EDIT SETS,取个名字，然后在FORCITE或者DISCOVER 里面应该看得见径向分布函数的标示是黑色的了。
赞一下(1人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
2楼2010-03-15 13:24:19
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lifei2008

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-15 13:24:19:
EDIT->ATOM SELECTION,选择好整个水分子，然后还是EDIT里面的EDIT SETS,取个名字，然后在FORCITE或者DISCOVER 里面应该看得见径向分布函数的标示是黑色的了。

多谢啦！
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生命不息，奋斗不止！
3楼2010-03-15 14:13:49
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by lifei2008 at 2010-03-15 14:13:49:

多谢啦！

小意思
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好好学习，天天向上。
4楼2010-03-22 08:56:22
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查看全部 16 个回答
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