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liujodan

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】固定原子过渡态计算问题

各位大侠,由于我的模型较大,所以在计算过渡态的时候,需要固定模型中的一部分原子。问题是,我能否用TS计算上述固定原子模型的过渡态?如果可以,请详细指教,谢谢大家~
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by galaxyqtm at 2010-03-16 11:04:25:

check if cartisian --> internal transform converged

不好意思,这是什么意思?
8楼2010-03-17 09:38:48
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查看全部 11 个回答

467266420

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
yjcmwgk(金币+3): 2010-03-14 12:32
liujodan(金币+2): 2010-03-14 05:41
引用回帖:
Originally posted by liujodan at 2010-03-13 20:10:59:
各位大侠,由于我的模型较大,所以在计算过渡态的时候,需要固定模型中的一部分原子。问题是,我能否用TS计算上述固定原子模型的过渡态?如果可以,请详细指教,谢谢大家~

你的模型大,你可以用HF或半经验的方法来算啊,如果你非要采用固定原子的办法也是可以的,你只需在分子说明项之后注明那些是要冻结的即可(比如冻结5,8号原子之间的距离:5  8  1.094        F)
2楼2010-03-14 10:58:47
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王中学

木虫 (正式写手)

海边拾贝的顽童


yjcmwgk(金币+1): 2010-03-14 12:32
liujodan(金币+1): 2010-03-14 05:41
我做得和你的差不多,我也是固定一部分原子找的过渡态
我是用直角坐标 然后用0和-1固定原子的
君当如兰,幽谷长风,宁静志远
3楼2010-03-14 11:25:36
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 王中学 at 2010-03-13 22:25:36:
我做得和你的差不多,我也是固定一部分原子找的过渡态
我是用直角坐标 然后用0和-1固定原子的

很奇怪的是,我确实也是用了0 -1 来固定原子的,但是出来的结果却发下 固定的原子出现了移动,得到的模型与原来有很大的差别。请赐教~~
4楼2010-03-14 18:43:17
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