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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】计算过程中提示输入文件错误
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yxddaisy

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】计算过程中提示输入文件错误

我在做优化的时候提示输入文件有错误
%Chk=hemei.chk
%mem=100MW
%nproc=1
Will use up to    1 processors via shared memory.
Default route:  MaxDisk=2000MB
----------------------------------
# opt am1 nosymm geom=connectivity
----------------------------------
1——……省略 -------------------
Title Card Required
-------------------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
C
C                    1    B1
C                    2    B2       1    A1
C                    3    B3       2    A2       1    D1       0
C                    4    B4       3    A3       2    D2       0
——……省略
C                    40   B42      39   A41      38   D40      0
C                    43   B43      40   A42      39   D41      0
C                    44   B44      43   A43      40   D42      0
C                    45   B45      44   A44      43   D43      0

H                    9    B63      8    A62      3    D61      0
H                    9    B64      8    A63      3    D62      0

H                    23   B74      5    A73      4    D72      0
H                    23   B75      5    A74      4    D73      0


H                    58   B109     57   A108     2    D107     0
H                    58   B110     57   A109     2    D108     0
H                    60   B111     59   A110     15   D109     0
H                    60   B112     59   A111     15   D110     0
H                    60   B113     59   A112     15   D111     0
       Variables:
  B1                    1.40119                  
  B2                    1.40729                  
  B3                    1.40726                  
  B4                    1.40603                  
  B5                    1.39923                  
  ……省略  
  D109                -57.00494                  
  D110                 63.01357                  
  D111               -177.07526                  


GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Initialization pass.
                           ----------------------------
                           !    Initial Parameters    !
                           ! (Angstroms and Degrees)  !
--------------------------                            --------------------------
! Name  Definition              Value          Derivative Info.                !
--------------------------------------------------------------------------------
! R1    R(1,2)                  1.4012         estimate D2E/DX2                !
! R2    R(1,6)                  1.3992         estimate D2E/DX2                !
! R3    R(1,61)                 1.0689         estimate D2E/DX2                !
! R4    R(2,3)                  1.4073         estimate D2E/DX2                !

省略
! D160  D(45,50,51,52)         87.9456         estimate D2E/DX2                !
! D161  D(45,50,51,54)        -91.5613         estimate D2E/DX2                !
! D162  D(101,50,51,52)       -31.3878         estimate D2E/DX2                !
! D163  D(50,51,52,53)        150.9943         estimate D2E/DX2                !
! D164  D(50,51,52,103)       -89.0148         estimate D2E/DX2                !
! D165  D(54,51,52,53)        -29.4963         estimate D2E/DX2                !
! D166  D(51,52,53,105)        61.514          estimate D2E/DX2                !
! D167  D(103,52,53,105)      -58.5337         estimate D2E/DX2                !
! D168  D(2,57,58,109)        -58.8967         estimate D2E/DX2                !
! D169  D(2,57,58,110)         61.1364         estimate D2E/DX2                !
! D170  D(15,59,60,112)       -57.0049         estimate D2E/DX2                !
! D171  D(15,59,60,113)        63.0136         estimate D2E/DX2                !
--------------------------------------------------------------------------------
Trust Radius=3.00D-01 FncErr=1.00D-07 GrdErr=1.00D-06
Number of steps in this run= 511 maximum allowed number of steps= 684.
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

Symmetry turned off by external request.
Stoichiometry    C47H54O13
Framework group  C1[X(C47H54O13)]
Deg. of freedom   336
Full point group                 C1      NOp   1
                         Z-Matrix orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1          6             0        0.000000    0.000000    0.000000
    2          6             0        0.000000    0.000000    1.401192
    3          6             0        1.217717    0.000000    2.106611
    4          6             0        2.429017    0.066621    1.393390
  省略
  112          1             0       -0.735086    2.404590    5.732689
  113          1             0       -0.121871    0.877120    5.141329
  114          1             0       -0.554633    1.052324    6.826556
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):      0.0685980      0.0158003      0.0152998
每次算到这儿就提示输入文件有错误，换过基组但是都没有用，不知为什么？
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1楼2010-03-11 21:34:13
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yxddaisy

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zhangnina626 at 2010-03-14 22:19:22:
将输出文件的错误信息拿出来看一下。

输出文件较长，我分七个帖子贴出来是：
1.
*********************************************
Gaussian 03:  x86-Win32-G03RevB.01 3-Mar-2003
                  15-Mar-2010
*********************************************
%chk=HEMEI.chk
%mem=20MW
%nproc=1
Will use up to    1 processors via shared memory.
Default route:  MaxDisk=4GB
-----------------------------------
#p opt am1 nosymm geom=connectivity
-----------------------------------
1/14=-1,18=50,26=3,38=1,57=2/1,3;
2/9=110,15=1,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=2,11=9,12=1,16=1,25=1,30=1/1;
4/5=3,11=1,20=5,22=1,24=3,35=1/1,2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2/1;
7/30=1/16;
1/14=-1,18=50/3(1);
99//99;
2/9=110,15=1/2;
3/5=2,11=9,12=1,16=1,25=1,30=1/1;
4/5=5,11=1,16=3,20=5,22=1,24=3,35=1/1,2;
7/30=1/16;
1/14=-1,18=50/3(-4);
2/9=110,15=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2/1;
99//99;
Leave Link    1 at Mon Mar 15 09:44:33 2010, MaxMem=   20971520 cpu:       1.0
(Enter d:\G03W\l101.exe)
-------------------
Title Card Required
-------------------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
C
C                    1    B1
C                    2    B2       1    A1
C                    3    B3       2    A2       1    D1       0
C                    4    B4       3    A3       2    D2       0
C                    1    B5       2    A4       3    D3       0
O                    6    B6       1    A5       2    D4       0
O                    3    B7       2    A6       1    D5       0
C                    8    B8       3    A7       2    D6       0
C                    9    B9       8    A8       3    D7       0
C                    10   B10      9    A9       8    D8       0
C                    11   B11      10   A10      9    D9       0
C                    12   B12      11   A11      10   D10      0
C                    13   B13      12   A12      11   D11      0
C                    14   B14      13   A13      12   D12      0
C                    11   B15      10   A14      9    D13      0
C                    12   B16      11   A15      10   D14      0
O                    17   B17      12   A16      11   D15      0
C                    17   B18      12   A17      11   D16      0
C                    19   B19      17   A18      12   D17      0
O                    20   B20      19   A19      17   D18      0
O                    20   B21      19   A20      17   D19      0
C                    5    B22      4    A21      3    D20      0
C                    23   B23      5    A22      4    D21      0
C                    24   B24      23   A23      5    D22      0
C                    25   B25      24   A24      23   D23      0
C                    26   B26      25   A25      24   D24      0
C                    27   B27      26   A26      25   D25      0
C                    24   B28      23   A27      5    D26      0
O                    28   B29      27   A28      26   D27      0
C                    30   B30      28   A29      27   D28      0
C                    29   B31      24   A30      23   D29      0
C                    27   B32      26   A31      25   D30      0
O                    33   B33      27   A32      26   D31      0
C                    33   B34      27   A33      26   D32      0
C                    35   B35      33   A34      27   D33      0
C                    36   B36      35   A35      33   D34      0
C                    37   B37      36   A36      35   D35      0
C                    38   B38      37   A37      36   D36      0
C                    39   B39      38   A38      37   D37      0
C                    40   B40      39   A39      38   D38      0
C                    41   B41      40   A40      39   D39      0
C                    40   B42      39   A41      38   D40      0
C                    43   B43      40   A42      39   D41      0
C                    44   B44      43   A43      40   D42      0
C                    45   B45      44   A44      43   D43      0
O                    39   B46      38   A45      37   D44      0
C                    47   B47      39   A46      38   D45      0
C                    44   B48      43   A47      40   D46      0
C                    45   B49      44   A48      43   D47      0
C                    50   B50      45   A49      44   D48      0
C                    51   B51      50   A50      45   D49      0
O                    52   B52      51   A51      50   D50      0
O                    51   B53      50   A52      45   D51      0
O                    35   B54      33   A53      27   D52      0
C                    19   B55      17   A54      12   D53      0
O                    2    B56      1    A55      6    D54      0
C                    57   B57      2    A56      1    D55      0
O                    15   B58      14   A57      13   D56      0
C                    59   B59      15   A58      14   D57      0
H                    1    B60      2    A59      57   D58      0
H                    4    B61      3    A60      2    D59      0
H                    7    B62      6    A61      1    D60      0
H                    9    B63      8    A62      3    D61      0
H                    9    B64      8    A63      3    D62      0
H                    13   B65      12   A64      11   D63      0
H                    14   B66      13   A65      12   D64      0
H                    16   B67      11   A66      10   D65      0
H                    16   B68      11   A67      10   D66      0
H                    16   B69      11   A68      10   D67      0
H                    17   B70      12   A69      11   D68      0
H                    18   B71      17   A70      12   D69      0
H                    19   B72      17   A71      12   D70      0
H                    22   B73      20   A72      19   D71      0
H                    23   B74      5    A73      4    D72      0
H                    23   B75      5    A74      4    D73      0
H                    25   B76      24   A75      23   D74      0
H                    26   B77      25   A76      24   D75      0
H                    31   B78      30   A77      28   D76      0
H                    31   B79      30   A78      28   D77      0
H                    32   B80      29   A79      24   D78      0
H                    32   B81      29   A80      24   D79      0
H                    33   B82      27   A81      26   D80      0
H                    34   B83      33   A82      27   D81      0
H                    36   B84      35   A83      33   D82      0
H                    36   B85      35   A84      33   D83      0
H                    37   B86      36   A85      35   D84      0
H                    38   B87      37   A86      36   D85      0
H                    38   B88      37   A87      36   D86      0
H                    39   B89      38   A88      37   D87      0
H                    42   B90      41   A89      40   D88      0
H                    42   B91      41   A90      40   D89      0
H                    43   B92      40   A91      39   D90      0
H                    46   B93      45   A92      44   D91      0
H                    48   B94      47   A93      39   D92      0
H                    48   B95      47   A94      39   D93      0
H                    48   B96      47   A95      39   D94      0
H                    49   B97      44   A96      43   D95      0
H                    49   B98      44   A97      43   D96      0
H                    49   B99      44   A98      43   D97      0
H                    50   B100     45   A99      44   D98      0
H                    50   B101     45   A100     44   D99      0
H                    52   B102     51   A101     50   D100     0
H                    52   B103     51   A102     50   D101     0
H                    53   B104     52   A103     51   D102     0
H                    56   B105     19   A104     17   D103     0
H                    56   B106     19   A105     17   D104     0
H                    56   B107     19   A106     17   D105     0
H                    58   B108     57   A107     2    D106     0
H                    58   B109     57   A108     2    D107     0
H                    58   B110     57   A109     2    D108     0
H                    60   B111     59   A110     15   D109     0
H                    60   B112     59   A111     15   D110     0
H                    60   B113     59   A112     15   D111     0

[ Last edited by yxddaisy on 2010-3-15 at 10:00 ]
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7楼2010-03-15 09:48:40
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zhangnina626

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
可能是对称性这块遇到问题了。
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暮凌
2楼2010-03-12 08:45:11
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yxddaisy

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zhangnina626 at 2010-03-12 08:45:11:
可能是对称性这块遇到问题了。

如果是这样该怎么办呢？我加了nosymm但是没有用
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3楼2010-03-12 09:53:19
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+3): 2010-03-12 17:26
看看是不是那个geom=connect导致的（可能是链接关系表出错了）。
如果下面没有链接关系表，就删掉这句话，如果有链接关系表，就把连接关系表和这句话都删掉。再试试看。
还有，你并没有给出足够的出错信息，连是101出错还是301出错还是502出错都没说，你也没说你的操作系统、gaussian的版本。还有以后保持一个习惯，#后面一定要加一个p，即写成
#p opt am1
这样子。这样就很容易知道它运行到哪里，何时出的错，错误原因大概是什么。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2010-03-12 14:46:52
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