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yxddaisy

新虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】计算过程中提示输入文件错误

我在做优化的时候提示输入文件有错误
%Chk=hemei.chk
%mem=100MW
%nproc=1
Will use up to 1 processors via shared memory.
Default route:  MaxDisk=2000MB
----------------------------------
# opt am1 nosymm geom=connectivity
----------------------------------
1——……省略 -------------------
Title Card Required
-------------------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
C
C                   1 B1
C                   2 B2    1 A1
C                   3 B3    2 A2    1 D1    0
C                   4 B4    3 A3    2 D2    0
——……省略
C                   40 B42    39 A41    38 D40    0
C                   43 B43    40 A42    39 D41    0
C                   44 B44    43 A43    40 D42    0
C                   45 B45    44 A44    43 D43    0

H                   9 B63    8 A62    3 D61    0
H                   9 B64    8 A63    3 D62    0

H                   23 B74    5 A73    4 D72    0
H                   23 B75    5 A74    4 D73    0

H                   58 B109    57 A108    2 D107    0
H                   58 B110    57 A109    2 D108    0
H                   60 B111    59 A110    15 D109    0
H                   60 B112    59 A111    15 D110    0
H                   60 B113    59 A112    15 D111    0
   Variables:
  B1                   1.40119
  B2                   1.40729
  B3                   1.40726
  B4                   1.40603
  B5                   1.39923
  ……省略
  D109             -57.00494
  D110                63.01357
  D111             -177.07526

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Initialization pass.
                        ----------------------------
                        ! Initial Parameters !
                        ! (Angstroms and Degrees)  !
--------------------------                         --------------------------
! Name  Definition             Value       Derivative Info.             !
--------------------------------------------------------------------------------
! R1 R(1,2)                1.4012       estimate D2E/DX2             !
! R2 R(1,6)                1.3992       estimate D2E/DX2             !
! R3 R(1,61)                1.0689       estimate D2E/DX2             !
! R4 R(2,3)                1.4073       estimate D2E/DX2             !

省略
! D160  D(45,50,51,52)       87.9456       estimate D2E/DX2             !
! D161  D(45,50,51,54)       -91.5613       estimate D2E/DX2             !
! D162  D(101,50,51,52)    -31.3878       estimate D2E/DX2             !
! D163  D(50,51,52,53)       150.9943       estimate D2E/DX2             !
! D164  D(50,51,52,103)    -89.0148       estimate D2E/DX2             !
! D165  D(54,51,52,53)       -29.4963       estimate D2E/DX2             !
! D166  D(51,52,53,105)       61.514       estimate D2E/DX2             !
! D167  D(103,52,53,105)    -58.5337       estimate D2E/DX2             !
! D168  D(2,57,58,109)       -58.8967       estimate D2E/DX2             !
! D169  D(2,57,58,110)       61.1364       estimate D2E/DX2             !
! D170  D(15,59,60,112)    -57.0049       estimate D2E/DX2             !
! D171  D(15,59,60,113)       63.0136       estimate D2E/DX2             !
--------------------------------------------------------------------------------
Trust Radius=3.00D-01 FncErr=1.00D-07 GrdErr=1.00D-06
Number of steps in this run= 511 maximum allowed number of steps= 684.
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

Symmetry turned off by external request.
Stoichiometry C47H54O13
Framework group  C1[X(C47H54O13)]
Deg. of freedom 336
Full point group                C1    NOp 1
                     Z-Matrix orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center    Atomic    Atomic             Coordinates (Angstroms)
Number    Number    Type             X          Y          Z
---------------------------------------------------------------------
1       6          0       0.000000 0.000000 0.000000
2       6          0       0.000000 0.000000 1.401192
3       6          0       1.217717 0.000000 2.106611
4       6          0       2.429017 0.066621 1.393390
  省略
  112       1          0    -0.735086 2.404590 5.732689
  113       1          0    -0.121871 0.877120 5.141329
  114       1          0    -0.554633 1.052324 6.826556
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):    0.0685980    0.0158003    0.0152998
每次算到这儿就提示输入文件有错误，换过基组但是都没有用，不知为什么？

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1楼2010-03-11 21:34:13

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zhangnina626

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可能是对称性这块遇到问题了。

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暮凌

2楼2010-03-12 08:45:11

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yxddaisy

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引用回帖:

Originally posted by zhangnina626 at 2010-03-12 08:45:11:
可能是对称性这块遇到问题了。

如果是这样该怎么办呢？我加了nosymm但是没有用

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3楼2010-03-12 09:53:19

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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

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yjcmwgk(金币+3): 2010-03-12 17:26

看看是不是那个geom=connect导致的（可能是链接关系表出错了）。
如果下面没有链接关系表，就删掉这句话，如果有链接关系表，就把连接关系表和这句话都删掉。再试试看。
还有，你并没有给出足够的出错信息，连是101出错还是301出错还是502出错都没说，你也没说你的操作系统、gaussian的版本。还有以后保持一个习惯，#后面一定要加一个p，即写成
#p opt am1
这样子。这样就很容易知道它运行到哪里，何时出的错，错误原因大概是什么。

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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以

4楼2010-03-12 14:46:52

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yxddaisy

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引用回帖:

Originally posted by zhangmt at 2010-03-12 14:46:52:
看看是不是那个geom=connect导致的（可能是链接关系表出错了）。
如果下面没有链接关系表，就删掉这句话，如果有链接关系表，就把连接关系表和这句话都删掉。再试试看。
还有，你并没有给出足够的出错信息，连是 ...

你好，
我用的是Gaussian03windows版的，我把geom=connect删掉了，还是运行到老地方就跳出说输入文件有误，我加了p ,结果是Leave Link 103 at Sun Mar 14 19:51:29 2010, MaxMem= 62914560 cpu: 0.0

[ Last edited by yxddaisy on 2010-3-14 at 20:05 ]

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5楼2010-03-14 19:34:38

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zhangnina626

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将输出文件的错误信息拿出来看一下。

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暮凌

6楼2010-03-14 22:19:22

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yxddaisy

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引用回帖:

Originally posted by zhangnina626 at 2010-03-14 22:19:22:
将输出文件的错误信息拿出来看一下。

输出文件较长，我分七个帖子贴出来是：
1.
*********************************************
Gaussian 03:  x86-Win32-G03RevB.01 3-Mar-2003
               15-Mar-2010
*********************************************
%chk=HEMEI.chk
%mem=20MW
%nproc=1
Will use up to 1 processors via shared memory.
Default route:  MaxDisk=4GB
-----------------------------------
#p opt am1 nosymm geom=connectivity
-----------------------------------
1/14=-1,18=50,26=3,38=1,57=2/1,3;
2/9=110,15=1,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=2,11=9,12=1,16=1,25=1,30=1/1;
4/5=3,11=1,20=5,22=1,24=3,35=1/1,2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2/1;
7/30=1/16;
1/14=-1,18=50/3(1);
99//99;
2/9=110,15=1/2;
3/5=2,11=9,12=1,16=1,25=1,30=1/1;
4/5=5,11=1,16=3,20=5,22=1,24=3,35=1/1,2;
7/30=1/16;
1/14=-1,18=50/3(-4);
2/9=110,15=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2/1;
99//99;
Leave Link 1 at Mon Mar 15 09:44:33 2010, MaxMem= 20971520 cpu:    1.0
(Enter d:\G03W\l101.exe)
-------------------
Title Card Required
-------------------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
C
C                   1 B1
C                   2 B2    1 A1
C                   3 B3    2 A2    1 D1    0
C                   4 B4    3 A3    2 D2    0
C                   1 B5    2 A4    3 D3    0
O                   6 B6    1 A5    2 D4    0
O                   3 B7    2 A6    1 D5    0
C                   8 B8    3 A7    2 D6    0
C                   9 B9    8 A8    3 D7    0
C                   10 B10    9 A9    8 D8    0
C                   11 B11    10 A10    9 D9    0
C                   12 B12    11 A11    10 D10    0
C                   13 B13    12 A12    11 D11    0
C                   14 B14    13 A13    12 D12    0
C                   11 B15    10 A14    9 D13    0
C                   12 B16    11 A15    10 D14    0
O                   17 B17    12 A16    11 D15    0
C                   17 B18    12 A17    11 D16    0
C                   19 B19    17 A18    12 D17    0
O                   20 B20    19 A19    17 D18    0
O                   20 B21    19 A20    17 D19    0
C                   5 B22    4 A21    3 D20    0
C                   23 B23    5 A22    4 D21    0
C                   24 B24    23 A23    5 D22    0
C                   25 B25    24 A24    23 D23    0
C                   26 B26    25 A25    24 D24    0
C                   27 B27    26 A26    25 D25    0
C                   24 B28    23 A27    5 D26    0
O                   28 B29    27 A28    26 D27    0
C                   30 B30    28 A29    27 D28    0
C                   29 B31    24 A30    23 D29    0
C                   27 B32    26 A31    25 D30    0
O                   33 B33    27 A32    26 D31    0
C                   33 B34    27 A33    26 D32    0
C                   35 B35    33 A34    27 D33    0
C                   36 B36    35 A35    33 D34    0
C                   37 B37    36 A36    35 D35    0
C                   38 B38    37 A37    36 D36    0
C                   39 B39    38 A38    37 D37    0
C                   40 B40    39 A39    38 D38    0
C                   41 B41    40 A40    39 D39    0
C                   40 B42    39 A41    38 D40    0
C                   43 B43    40 A42    39 D41    0
C                   44 B44    43 A43    40 D42    0
C                   45 B45    44 A44    43 D43    0
O                   39 B46    38 A45    37 D44    0
C                   47 B47    39 A46    38 D45    0
C                   44 B48    43 A47    40 D46    0
C                   45 B49    44 A48    43 D47    0
C                   50 B50    45 A49    44 D48    0
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O                   51 B53    50 A52    45 D51    0
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C                   19 B55    17 A54    12 D53    0
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C                   57 B57    2 A56    1 D55    0
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  A49                107.96267
  A50                118.99773
  A51                109.77104
  A52                120.74142
  A53                120.94443
  A54                109.98347
  A55                119.17094
  A56                109.65917
  A57                119.62039
  A58                109.92698
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  A60                120.16218
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  A78                113.56891
  A79                110.13906
  A80                115.15183
  A81                107.83993
  A82                109.80983
  A83                110.39981
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  A85                109.69055
  A86                110.41841
  A87                109.14219
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  A90                108.14582
  A91                119.96997
  A92                120.18455
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  D65             -150.29291
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  D73                -36.39713
  D74                1.00837
  D75                178.60421
  D76                -73.69634
  D77                165.12752
  D78                88.58341
  D79                -33.58975
  D80                148.00282
  D81                -60.93934
  D82                -81.73124
  D83                38.28571
  D84                -53.78857
  D85                68.56854
  D86             -171.3053
  D87                64.59729
  D88                147.49052
  D89                -92.6806
  D90                7.60849
  D91             -176.44304
  D92                179.74857
  D93                59.80586
  D94                -60.23058
  D95                150.15272
  D96                -89.74253
  D97                30.14054
  D98                34.01896
  D99                154.42771
  D100             -89.01484
  D101                30.93767
  D102                61.51397
  D103             179.55695
  D104                59.58942
  D105             -60.47283
  D106             -58.89671
  D107                61.13638
  D108             -178.7745
  D109             -57.00494
  D110                63.01357
  D111             -177.07526
Fast transformation storage of 1 MWords has been initialized.
                  Isotopes and Nuclear Properties:

  Atom       1          2          3          4          5          6          7          8          9       10
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Leave Link  101 at Mon Mar 15 09:44:33 2010, MaxMem= 20971520 cpu:    0.0
(Enter d:\G03W\l103.exe)

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Initialization pass.
                        ----------------------------
                        ! Initial Parameters !
                        ! (Angstroms and Degrees)  !
--------------------------                         --------------------------
! Name  Definition             Value       Derivative Info.             !
--------------------------------------------------------------------------------
! R1 R(1,2)                1.4012       estimate D2E/DX2             !
! R2 R(1,6)                1.3992       estimate D2E/DX2             !
! R3 R(1,61)                1.0689       estimate D2E/DX2             !
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! R5 R(2,57)                1.432       estimate D2E/DX2             !
! R6 R(3,4)                1.4073       estimate D2E/DX2             !
! R7 R(3,8)                1.4368       estimate D2E/DX2             !

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