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hhaidong

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助/交流】求助蘑菇分子分类鉴定方法

计划快速鉴定一种蘑菇，请问能用真菌鉴定的通用引物进行PCR吗？
ITS1-5.8S-ITS2
ITS1 5 ' - TCCGTAGGTGAACCTGCGG -3'
ITS4 5' - TCCTCCGCTTATTGATATGC -3'

18Sr DNA
NS1 5 ' - GTAGTCATATGCTTGTCTC -3'
NS8 5 ' - TCCGCAGGTTCACCTACGGA -3'

还有，提DNA时与细菌破壁有何操作差别和注意事项！

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1楼 2010-03-10 19:19:56

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hhaidong

木虫 (正式写手)

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多谢！

多谢！请问18Sr DNA测序对蘑菇的分类鉴定没有意义吗？是否有必要做？

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5楼2010-03-11 10:53:35

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sdhcy

木虫 (初入文坛)

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★ ★
hhaidong(金币+1):谢谢参与
hhaidong(金币+5):多谢！请问18Sr DNA测序对蘑菇的分类鉴定没有意义吗？是否有必要做？ 2010-03-11 10:52
1949stone(金币+1): 2010-03-14 11:31

可以使用。ITS1和ITS4的引物。

但是GenBank的比对结果，不一定好用。
因为有时候你得到的结果和两个不同的种的相似度都是99％或者100％。不知道需要采用哪个。最好有形态特征加以辅助。

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2楼2010-03-11 02:09:59

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海神

木虫 (著名写手)

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★
hhaidong(金币+1):谢谢参与

我知道的就是GenBank

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只努力，不比较

4楼2010-03-11 10:47:43

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sdhcy

木虫 (初入文坛)

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引用回帖:

Originally posted by hhaidong at 2010-03-11 10:53:35:
多谢！请问18Sr DNA测序对蘑菇的分类鉴定没有意义吗？是否有必要做？

如果是鉴定蘑菇（食用菌）的话，个人认为不用做18S rDNA（因为种间的变异比较小）。只要ITS1 和ITS4扩增的序列结果。

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6楼2010-03-14 00:28:54

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