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hhaidong

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】求助蘑菇分子分类鉴定方法

计划快速鉴定一种蘑菇，请问能用真菌鉴定的通用引物进行PCR吗？
ITS1-5.8S-ITS2
ITS1    5 ' - TCCGTAGGTGAACCTGCGG -3'
ITS4    5' - TCCTCCGCTTATTGATATGC -3'

18Sr DNA
NS1   5 ' - GTAGTCATATGCTTGTCTC -3'
NS8   5 ' - TCCGCAGGTTCACCTACGGA -3'

还有，提DNA时与细菌破壁有何操作差别和注意事项！
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1楼 2010-03-10 19:19:56
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sdhcy

木虫 (初入文坛)
★ ★
hhaidong(金币+1):谢谢参与
hhaidong(金币+5):多谢！请问18Sr DNA测序对蘑菇的分类鉴定没有意义吗？是否有必要做？ 2010-03-11 10:52
1949stone(金币+1): 2010-03-14 11:31
可以使用。ITS1和ITS4的引物。

但是GenBank的比对结果，不一定好用。
因为有时候你得到的结果和两个不同的种的相似度都是99％或者100％。不知道需要采用哪个。最好有形态特征加以辅助。
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2楼2010-03-11 02:09:59
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主
★
hhaidong(金币+1):谢谢参与
可以见到
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3楼2010-03-11 08:24:27
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海神

木虫 (著名写手)
★
hhaidong(金币+1):谢谢参与
我知道的就是GenBank
赞一下(1人) 回复此楼
只努力，不比较
4楼2010-03-11 10:47:43
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hhaidong

木虫 (正式写手)

多谢！

多谢！请问18Sr DNA测序对蘑菇的分类鉴定没有意义吗？是否有必要做？
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5楼2010-03-11 10:53:35
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sdhcy

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by hhaidong at 2010-03-11 10:53:35:
多谢！请问18Sr DNA测序对蘑菇的分类鉴定没有意义吗？是否有必要做？

如果是鉴定蘑菇（食用菌）的话，个人认为不用做18S rDNA（因为种间的变异比较小）。只要ITS1 和ITS4扩增的序列结果。
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6楼2010-03-14 00:28:54
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月月大可

木虫 (著名写手)
★ ★
hhaidong(金币+1):谢谢参与
1949stone(金币+1): 2010-03-14 11:31
hhaidong(金币+1): 2010-03-14 16:15
看看中国农业科学院张金霞学生的学位论文，那里一直在做食用菌的分子标记。有筛选的比较好的引物。

[ Last edited by 月月大可 on 2010-3-15 at 16:20 ]
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7楼2010-03-14 10:06:31
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