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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】material studio4.4中dmol3遇到的问题

我做了一个“碳纳米管和表面活性剂离子液体”的体系，有格子。但是用dmol3做动力学时，生成的“status”文件中，“Dynamics Step ”显示的是“0 of 0”，这是怎么回事？顺便说一下，下面的“SCF Iteration ”显示的是32（最大循环 50），那个SCF是什么意思？还有就是现在体系还没有算完，不过已经算了快一天了。请大家帮我一下。

[ Last edited by wangdading on 2010-3-5 at 11:12 ]
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前途是光明的，道路是曲折的。
1楼 2010-03-05 10:31:17
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04nylxb

木虫 (正式写手)
★
wuli8(金币+1):感谢 2010-03-07 22:28
wangdading(金币+1): 2010-03-15 10:22
SCF是自洽场计算，多体问题，一开始要给一个波函数的初值，然后才能开始迭代计算
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集中精力发文章
2楼2010-03-07 21:32:59
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yjmaxpayne

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+5):谢谢专家指点 2010-03-08 10:31
wangdading(金币+2):简洁明了 2010-03-15 10:22
Dmol的动力学是第一性原理动力学， 每一步都需要通过自洽运算得到能量还有力， 从而决原子下一步的坐标，以及其速度。 如果你的系统原子数量大的话， 慢是很正常的。

建议先用Forcite，Discover或者是Gulp进行经典动力学演化后再酌情考虑使用第一性原理动力学进行运算。

另外，如果你的系统很大的话，可以考虑使用DPD来进行介观动力学的演化。
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3楼2010-03-08 10:00:25
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by yjmaxpayne at 2010-03-08 10:00:25:
Dmol的动力学是第一性原理动力学， 每一步都需要通过自洽运算得到能量还有力， 从而决原子下一步的坐标，以及其速度。 如果你的系统原子数量大的话， 慢是很正常的。

建议先用Forcite，Discover或者是Gulp进行 ...

恩，确实是体系太大的原因。那么我现在问一下，(5，5)且重复单元只有6碳纳米管用dmol算结构优化，为啥不给算呢？老是死呢？
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4楼2010-03-13 08:44:54
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yjmaxpayne

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wangdading at 2010-03-13 08:44:54:

恩，确实是体系太大的原因。那么我现在问一下，(5，5)且重复单元只有6碳纳米管用dmol算结构优化，为啥不给算呢？老是死呢？

（5，5）x6 的结构已经有140个原子了， 这对于第一性原理计算，已经不是一个小数目了。 这个时候需要的内存很多， 如果你的内存不在4G以上，必然一算就会死机。
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5楼2010-03-16 09:56:52
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by yjmaxpayne at 2010-03-16 09:56:52:


（5，5）x6 的结构已经有140个原子了， 这对于第一性原理计算，已经不是一个小数目了。 这个时候需要的内存很多， 如果你的内存不在4G以上，必然一算就会死机。

确实是这样啊。而且问题是不怎么收敛。那样的话，有什么方法可以提让计算快点呢？特别是在参数的设置上？
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6楼2010-03-16 10:30:59
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