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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】material studio4.4中dmol3遇到的问题

我做了一个“碳纳米管和表面活性剂离子液体”的体系,有格子。但是用dmol3做动力学时,生成的“status”文件中,“Dynamics Step ”显示的是“0 of 0”,这是怎么回事?顺便说一下,下面的“SCF Iteration ”显示的是32(最大循环 50),那个SCF是什么意思?还有就是现在体系还没有算完,不过已经算了快一天了。请大家帮我一下。

[ Last edited by wangdading on 2010-3-5 at 11:12 ]
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前途是光明的,道路是曲折的。
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04nylxb

木虫 (正式写手)


wuli8(金币+1):感谢 2010-03-07 22:28
wangdading(金币+1): 2010-03-15 10:22
SCF是自洽场计算,多体问题,一开始要给一个波函数的初值,然后才能开始迭代计算
集中精力发文章
2楼2010-03-07 21:32:59
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yjmaxpayne

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+5):谢谢专家指点 2010-03-08 10:31
wangdading(金币+2):简洁明了 2010-03-15 10:22
Dmol的动力学是第一性原理动力学, 每一步都需要通过自洽运算得到能量还有力, 从而决原子下一步的坐标,以及其速度。 如果你的系统原子数量大的话, 慢是很正常的。

建议先用Forcite,Discover或者是Gulp进行经典动力学演化后再酌情考虑使用第一性原理动力学进行运算。

另外,如果你的系统很大的话,可以考虑使用DPD来进行介观动力学的演化。
3楼2010-03-08 10:00:25
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by yjmaxpayne at 2010-03-08 10:00:25:
Dmol的动力学是第一性原理动力学, 每一步都需要通过自洽运算得到能量还有力, 从而决原子下一步的坐标,以及其速度。 如果你的系统原子数量大的话, 慢是很正常的。

建议先用Forcite,Discover或者是Gulp进行 ...

恩,确实是体系太大的原因。那么我现在问一下,(5,5)且重复单元只有6碳纳米管用dmol算结构优化,为啥不给算呢?老是死呢?
前途是光明的,道路是曲折的。
4楼2010-03-13 08:44:54
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yjmaxpayne

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wangdading at 2010-03-13 08:44:54:

恩,确实是体系太大的原因。那么我现在问一下,(5,5)且重复单元只有6碳纳米管用dmol算结构优化,为啥不给算呢?老是死呢?

(5,5)x6 的结构已经有140个原子了, 这对于第一性原理计算,已经不是一个小数目了。 这个时候需要的内存很多, 如果你的内存不在4G以上,必然一算就会死机。
5楼2010-03-16 09:56:52
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by yjmaxpayne at 2010-03-16 09:56:52:


(5,5)x6 的结构已经有140个原子了, 这对于第一性原理计算,已经不是一个小数目了。 这个时候需要的内存很多, 如果你的内存不在4G以上,必然一算就会死机。

确实是这样啊。而且问题是不怎么收敛。那样的话,有什么方法可以提让计算快点呢?特别是在参数的设置上?
前途是光明的,道路是曲折的。
6楼2010-03-16 10:30:59
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