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cw19991

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】想做色谱固定相和手性分子之间作用的分子模拟

想做色谱固定相和待分离的手性分子之间作用的分子模拟,不知道如何建立模型。我们的固定相一般用键合或者涂覆的办法将修饰的化合物接到硅胶上,现在主要想评价固定相的分离能力,有些文献上说用晶体数据库找到相关化合物数据,再来建模,不能直接在chem3D上绘制出分子结构,再去能量最低化吗?
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

★ ★
cw19991(金币+6):谢谢!有问题再向您请教。 2010-03-08 15:25
lei0736(金币+2):谢谢 2010-03-08 17:08
是你们自己合成的?那不错,很有创新的空间,那么就需要一个懂得解析晶体结构的人,使用相关的软件,对你们合成的晶体结构做的单晶XRD图谱进行解析,这样就可以获得关于各个原子坐标的CIF文件。MS软件是可以导入这个CIF文件的。导入之后删除多余的原子,比如晶体中的杂质原子,某个原子的多个存在(保留一个即可),然后使用MS软件中的Forcite模块或者Dmol3模块对这个结果进行优化,包括空间位置的小范围调整等等,之后的过程就是我上面所说的。
7楼2010-03-08 15:18:41
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dacapo

木虫 (正式写手)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-05 11:21
用chem3D应该可以做吧
发文章才是王道啊!
2楼2010-03-05 10:20:52
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cw19991

铁杆木虫 (著名写手)

继续关注,恳请高手指教!
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3楼2010-03-06 22:25:05
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-03-07 10:09
cw19991(金币+4):谢谢,应该涉及到,但是不知道如何建模,课题组第一次做这个,能否指导一下? 2010-03-07 22:49
中间应该涉及吸附和扩散的过程吧?
我不是很懂,如果是吸附和扩散过程,那么问题就明朗了。
MC和MD的程序软件都可以实现了。
4楼2010-03-07 09:20:36
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