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丁香瓜

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】southern blot实验怎样做对照实验啊?

投稿返回大修意见,其中一条是
2) At least a subset of the data is below acceptable academic standards. Specifically, Figure 7 (我的southern blot图片)lacks a number of controls and additional data should be presented to provide molecular context to the results.

另外
4) Figures 2 to 7 have very limited information content and can easily be reproduced with broadly available bioinformatics programs. These data should be presented as on-line Supplementary Data to conserve printed journal space.
Figures 2 to 7 分别是基因的全长图、蛋白同源比对图、蛋白二级结构图、蛋白的三级结构图、southern blot图。这个是文章的主体部分,如果放到on-line Supplementary 部分,文章就没有什么内容了。
请大家帮忙分析一下,另外请有经验的战友给点建议,利用RACE同源克隆获得的基因如何发表文章?谢谢
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段家一凡

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
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1949stone(金币+2): 2010-02-18 23:32
你的是转基因植株的southern图吗?如果是应该加上非转基因的对照。如果是不同酶切的southern图,该图是有问题的,BamHI和HindIII的都有3条带,说明你用的探针在你的材料的基因组上至少有有3个拷贝,为什么EcoRI只有一条主带呢?还能看到其他4条很淡的带,但是与主带来比差太多了,还不能算杂交带(理论上应该亮度差不多,就像前两个酶切一样)。另外你的图还缺少marker。
2楼2010-02-18 20:45:31
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wenzhenice

木虫 (正式写手)

★ ★
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司马诸葛(金币+1): 2010-03-30 19:01
its better to add positive control and negative control to support your result,it will strongly confirm your experiment!
3楼2010-02-19 02:04:56
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丁香瓜

金虫 (小有名气)

谢谢楼上两位战友。
文章中的southern blot图是三个酶BamHI、HindIII和EcoRI分别酶切植物的基因组(不是转基因材料),单单来看基因组有几个拷贝数。请问怎样加上阳性和阴性对照了?还有Marker是一定要加上的吗?
第一次做核酸杂交,请各位老师多多指点,该Southern Blot杂交实验,该如何做才能达到要求了,需要重新做吗?
4楼2010-02-19 15:23:37
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我是懒人

铁虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
只是同源序列克隆+一个拷贝数检测么?还有没有别的比如表达量的分析之类的?投的什么杂志?
5楼2010-02-23 01:49:54
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