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jiyuch

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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[交流] 【求助】NH3·H2O在水中的能量

本人纯新手，摸爬滚打半天，没琢磨出l如何利用gaussian算NH3·H20的能量，有高手帮个忙吗？提前拜个年！

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1楼2010-02-10 10:21:40

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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

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专业: 理论和计算化学

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+6):貌似咱们理论计算还确实是够用就行，哈哈。感谢zhangmt先生的真知灼见 2010-02-13 09:39

诚如所言，PCM模型下的计算太过粗略。
jcas上溶剂化的文章看过一部分，也看过一些介绍溶剂化计算的书，理解起来有些费解，有些冲突。
比如，过去文章习惯上都是用气相中的过渡态结构，维持构型，直接在溶剂模型下做单点算，但是在书上有介绍说，是因为溶剂化下难以得到合适的过渡态——那我的理解就是：1、在可行的情况下，应该是反应物、产物、过渡态都是在溶剂化下做优化，只是过去由于技术手段的限制，而多数仅采用气相中过渡态结构直接溶剂化下单点算来做近似；2、另一种解释是过渡态属于极不稳定的状态，所以在溶剂化下过渡态是来不及做结构松弛的，所以仍以气相中过渡态结构存在，此时单点算就是合理的。到底何者应该采信，这是矛盾之一（我倾向于前者）；
矛盾之二：溶剂化下优化，得到的Total free energy in solution with all non electrostatic terms 既包含了极化部分也包括了非静电项，得到的是吉布斯自由能，也就是SCF算出来的数据本身已经是松弛化以后的能量（极化部分），再加上一个非静电项而得到的数据，那么这个值的来历就很值得怀疑——SCF是解自洽场得到的电子的能量，如果不做熵的计算（通过配分函数得到），那么从何得来吉布斯自由能呢？G=H-TS啊。而无论热力学还是动力学，真正可以用公式计算的都是G，而不是H，而量化只有H是可信的，G是配分函数算出来的S再对H做的校正，一般气相中还勉强说得过去，而溶剂化中频率分析、熵的计算又都不可信，那么就出来矛盾了：可信的没有用，有用的不可信，那么，溶剂化下到底怎么做呢？
如果算出来的结果能够符合实验，也就没有人深究了，直接蒙混过关了，而一旦与实验相违，就要找出个道道出来。也不是说溶剂化就一概不可信，jacs也有文章因为计算气相过渡态能垒太高过不去，结果做了溶剂化效应后明显能垒降低了，结果就发了文章，自圆其说的。难道一切都是够用就行？

[ Last edited by zhangmt on 2010-2-12 at 23:08 ]