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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 文献解析 » 【求助】紧急求助高手关于晶体结构中偏差值的问题
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【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 风声小淇 的 17 个金币

风声小淇

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】紧急求助高手关于晶体结构中偏差值的问题

今天刚接到的proof里有两处关于偏差值需要修改的，有哪位大侠帮忙看下，重金酬谢~
1.
the S atoms are almost
coplanar with the benzene rings to which they are bonded
[give deviations from planes].

2.
– interactions between benzene rings
are present, with a face-to-face stacking distance of
3.622 (su?) A ˚ .

在线等待啊~
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1楼2010-02-09 23:47:34
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forever1706

禁虫 (知名作家)
风声小淇(金币+3): 2010-02-10 11:24
２.在ins文件中加入命令mpla C1 C2 C3 C4 C5 C6
mpla C7 C8 C9 C10 C11 C12，当然，C的编号要给你的那个苯环的。然后精修，看行不行，或者在lst中找找。具体有点忘了。

[ Last edited by forever1706 on 2010-2-10 at 10:49 ]
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2楼2010-02-10 10:38:24
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风声小淇

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by forever1706 at 2010-02-10 10:38:24:
２.在ins文件中加入命令mpla C1 C2 C3 C4 C5 C6
mpla C7 C8 C9 C10 C11 C12，当然，C的编号要给你的那个苯环的。然后精修，看行不行，或者在lst中找找。具体有点忘了。

[ Last edited by forever1706 on 20 ...

你说的是第二个关于pi-pi堆积的么？
其实这两个都是关于偏差的，仅给出个估计值是否可以呢？
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3楼2010-02-10 11:24:14
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forever1706

禁虫 (知名作家)
应该有办法可以看到偏差的，我弄清楚了再给你回复。给个估计值不好吧。
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4楼2010-02-10 11:47:24
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风声小淇

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by forever1706 at 2010-02-10 11:47:24:
应该有办法可以看到偏差的，我弄清楚了再给你回复。给个估计值不好吧。

先谢谢啦，不过这个比较急，马上就要改好给编辑的，我也在想办法
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5楼2010-02-10 13:09:16
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li_junxia6281

木虫 (著名写手)
★
风声小淇(金币+5): 2010-02-10 23:54
eeqeeq0002(金币+1):谢谢 参与 2010-02-11 17:38
在diamond里很好找的。

1：建立最小二乘平面-（苯环6个原子所在的平面），测定S原子到该平面的距离即可得到偏离值。

2：在每个苯环中插入一个中心原子，类似1，分别建立2个最小二乘平面，测量这两个中心原子的距离，就会有带有deviation的数值。

祝你好运！！

类似。建立
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6楼2010-02-10 21:55:53
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风声小淇

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by li_junxia6281 at 2010-02-10 21:55:53:
在diamond里很好找的。

1：建立最小二乘平面-（苯环6个原子所在的平面），测定S原子到该平面的距离即可得到偏离值。

2：在每个苯环中插入一个中心原子，类似1，分别建立2个最小二乘平面，测量这两个中心原子 ...

麻烦你可以说的再清楚具体些么？diamond在什么地方看？如何操作？
谢谢啦
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7楼2010-02-10 23:56:50
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li_junxia6281

木虫 (著名写手)
★ ★
eeqeeq0002(金币+2):谢谢 参与 2010-02-11 17:38
风声小淇(金币+5): 2010-02-12 00:17
用diamond打开你的cif文件，按住ctrl键选中苯环所在的6个原子，菜单Object---planes---creat planes through atoms---点击确定，就建立了第一个平面。

然后选中S原子，点击菜单tools---calcuate---distances from plane--就会显示原子到你选定的平面的距离。


对于两个最小二乘平面的心心距离，在两个平面中插入dummy原子，测定这两个原子之间的距离即可！！


不行的话我帮你量！！你把cif发给我。


祝福你！！
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8楼2010-02-11 14:19:36
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风声小淇

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by li_junxia6281 at 2010-02-11 14:19:36:
用diamond打开你的cif文件，按住ctrl键选中苯环所在的6个原子，菜单Object---planes---creat planes through atoms---点击确定，就建立了第一个平面。

然后选中S原子，点击菜单tools---calcuate---distances f ...

你加我QQ具体聊吧，334262614，谢谢了
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9楼2010-02-12 00:14:57
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风声小淇

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by li_junxia6281 at 2010-02-11 14:19:36:
用diamond打开你的cif文件，按住ctrl键选中苯环所在的6个原子，菜单Object---planes---creat planes through atoms---点击确定，就建立了第一个平面。

然后选中S原子，点击菜单tools---calcuate---distances f ...

我已经按照你说的做了，想和你再交流核对下哦
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10楼2010-02-12 00:42:05
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