24小时热门版块排行榜    

查看: 612  |  回复: 10
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 风声小淇 的 17 个金币

风声小淇

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】紧急求助高手关于晶体结构中偏差值的问题

今天刚接到的proof里有两处关于偏差值需要修改的,有哪位大侠帮忙看下,重金酬谢~
1.
the S atoms are almost
coplanar with the benzene rings to which they are bonded
[give deviations from planes].

2.
– interactions between benzene rings
are present, with a face-to-face stacking distance of
3.622 (su?) A ˚ .

在线等待啊~
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)

风声小淇(金币+3): 2010-02-10 11:24
2.在ins文件中加入命令mpla C1 C2 C3 C4 C5 C6
mpla C7 C8 C9 C10 C11 C12,当然,C的编号要给你的那个苯环的。然后精修,看行不行,或者在lst中找找。具体有点忘了。

[ Last edited by forever1706 on 2010-2-10 at 10:49 ]
2楼2010-02-10 10:38:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风声小淇

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by forever1706 at 2010-02-10 10:38:24:
2.在ins文件中加入命令mpla C1 C2 C3 C4 C5 C6
mpla C7 C8 C9 C10 C11 C12,当然,C的编号要给你的那个苯环的。然后精修,看行不行,或者在lst中找找。具体有点忘了。

[ Last edited by forever1706 on 20 ...

你说的是第二个关于pi-pi堆积的么?
其实这两个都是关于偏差的,仅给出个估计值是否可以呢?
3楼2010-02-10 11:24:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)

应该有办法可以看到偏差的,我弄清楚了再给你回复。给个估计值不好吧。
4楼2010-02-10 11:47:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风声小淇

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by forever1706 at 2010-02-10 11:47:24:
应该有办法可以看到偏差的,我弄清楚了再给你回复。给个估计值不好吧。

先谢谢啦,不过这个比较急,马上就要改好给编辑的,我也在想办法
5楼2010-02-10 13:09:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

li_junxia6281

木虫 (著名写手)


风声小淇(金币+5): 2010-02-10 23:54
eeqeeq0002(金币+1):谢谢 参与 2010-02-11 17:38
在diamond里很好找的。

1:建立最小二乘平面-(苯环6个原子所在的平面),测定S原子到该平面的距离即可得到偏离值。

2:在每个苯环中插入一个中心原子,类似1,分别建立2个最小二乘平面,测量这两个中心原子的距离,就会有带有deviation的数值。

祝你好运!!

类似。建立
6楼2010-02-10 21:55:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风声小淇

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by li_junxia6281 at 2010-02-10 21:55:53:
在diamond里很好找的。

1:建立最小二乘平面-(苯环6个原子所在的平面),测定S原子到该平面的距离即可得到偏离值。

2:在每个苯环中插入一个中心原子,类似1,分别建立2个最小二乘平面,测量这两个中心原子 ...

麻烦你可以说的再清楚具体些么?diamond在什么地方看?如何操作?
谢谢啦
7楼2010-02-10 23:56:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

li_junxia6281

木虫 (著名写手)

★ ★
eeqeeq0002(金币+2):谢谢 参与 2010-02-11 17:38
风声小淇(金币+5): 2010-02-12 00:17
用diamond打开你的cif文件,按住ctrl键选中苯环所在的6个原子,菜单Object---planes---creat planes through atoms---点击确定,就建立了第一个平面。

然后选中S原子,点击菜单tools---calcuate---distances from plane--就会显示原子到你选定的平面的距离。


对于两个最小二乘平面的心心距离,在两个平面中插入dummy原子,测定这两个原子之间的距离即可!!


不行的话我帮你量!!你把cif发给我。


祝福你!!
8楼2010-02-11 14:19:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风声小淇

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by li_junxia6281 at 2010-02-11 14:19:36:
用diamond打开你的cif文件,按住ctrl键选中苯环所在的6个原子,菜单Object---planes---creat planes through atoms---点击确定,就建立了第一个平面。

然后选中S原子,点击菜单tools---calcuate---distances f ...

你加我QQ具体聊吧,334262614,谢谢了
9楼2010-02-12 00:14:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风声小淇

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by li_junxia6281 at 2010-02-11 14:19:36:
用diamond打开你的cif文件,按住ctrl键选中苯环所在的6个原子,菜单Object---planes---creat planes through atoms---点击确定,就建立了第一个平面。

然后选中S原子,点击菜单tools---calcuate---distances f ...

我已经按照你说的做了,想和你再交流核对下哦
10楼2010-02-12 00:42:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 风声小淇 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 让我中一个面上吧! +8 大萍1987 2026-08-20 10/500 2026-08-20 21:48 by 大萍1987
[基金申请] 言之凿凿,明天官网会通知放榜? +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
信息提示
请填处理意见