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hapwave

荣誉版主 (著名写手)

向日阳光

[交流] 【求助】xp 和 platon得到氢键不一样呀,怎么办?

xp 和 platon得到氢键不一样呀,怎么办?

1、写文章时我只用了.tex文件的几个数据
如果用怎样在cif文件里加上氢键?直接把platon.lst的数据按格式加进去行吗?

2、是不是堆积图也要重新画?怎么操作呢

哪位兄弟能帮忙?太急了,我把文件发给你,同时以50金币作谢意!

Xp   .tex文件

Table 7.  Hydrogen bonds for r080124a [A and deg.].
____________________________________________________________________________
   D-H...A                      d(D-H)      d(H...A)    d(D...A)    <(DHA)
   N(1)-H(1)...O(4)#1           0.927(17)   1.849(17)   2.7459(15)  162.1(14)
O(4)-H(4B)...O(3)#2          0.89(2)     1.97(2)     2.8391(14)  166.2(18)
O(4)-H(4A)...O(1)            0.92(2)     1.84(2)     2.7625(16)  174.4(19)
____________________________________________________________________________
   Symmetry transformations used to generate equivalent atoms:  #1 x,-y+2,z+1/2    #2 -x+3/2,-y+3/2,-z+1     

plarton的Palton.Lst文件
Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [    ARU  ]      D - H      H...A      D...A  D - H...A    A..H..A* A'..H..A" Sum(XY,YZ)  Sum(XZ)
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
1       1 N(1)  --H(1)   ..O(4)   [  4554.02]  0.927(17)  1.849(17) 2.7461(16)  162.2(16)
2       2 O(4)  --H(4A)  ..O(1)   [         ]    0.92(2)    1.84(2) 2.7626(15)     174(2)
3       2 O(4)  --H(4B)  ..O(3)   [  7556.01]    0.89(2)    1.97(2) 2.8392(15)     166(2)
  4      1 C(3)  --H(3)   ..F(3)   [  2554.01]       0.95       2.51 3.2676(18)        137
5       1 C(4)  --H(4)   ..O(4)   [  4554.02]       0.95       2.55   3.462(2)        160
6       1 C(10) --H(10)  ..O(2)   [  7546.01]       1.00       2.46 3.3113(17)        143
7       1 C(14) --H(14)  ..F(2)   [  8555.01]       1.00       2.54 3.1998(17)        123
8       1 C(15) --H(15)  ..O(3)   [  7556.01]       1.00       2.43 3.2838(16)        143
9       1 C(17) --H(17)  ..O(3)   [  6545.01]       0.95       2.50 3.2373(17)        134

Translation of ARU-code to Equivalent Position Code
===================================================
   [  2554. ]  = -x,y,-1/2-z           [  7556. ]  = 1/2-x,1/2-y,1-z        [  6545. ]  = 1/2-x,-1/2+y,1/2-z
   [  7546. ]  = 1/2-x,-1/2-y,1-z      [  4554. ]  = x,-y,-1/2+z            [  8555. ]  = 1/2+x,1/2-y,1/2+z

[ Last edited by hapwave on 2010-2-6 at 10:40 ]
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yy0520yy

金虫 (职业作家)


hapwave(金币+1):谢谢参与
hapwave(金币+10): 2010-02-06 12:14
5楼2010-02-06 11:17:27
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yy0520yy

金虫 (职业作家)

特别注意对称操作码!!!!!!
6楼2010-02-06 11:18:22
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