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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】请教大家两个问题
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hijing

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教大家两个问题

1.我用Autodock做蛋白和小分子对接，对接前要对蛋白和小分子进行能量优化，不知大家都用什么软件？有免费或能下载到的吗？好心给推荐一下。
2.有没有用于对接后的能量计算软件，能不能给推荐一下。当然还是免费的或能下载的更好。
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1楼 2010-02-04 16:53:06
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y.q.liu

金虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-02-21 19:38
hijing(金币+5): 2010-03-08 10:51
引用回帖:
Originally posted by hijing at 2010-02-04 16:53:06:
1.我用Autodock做蛋白和小分子对接，对接前要对蛋白和小分子进行能量优化，不知大家都用什么软件？有免费或能下载到的吗？好心给推荐一下。
2.有没有用于对接后的能量计算软件，能不能给推荐一下。当然还是免费的 ...

不知道dock6 named行不行？
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2楼2010-02-21 18:59:22
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arthurii

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-02-23 12:29
hijing(金币+5): 2010-03-08 10:52
Autodock本身就可以计算能量的
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3楼2010-02-23 09:47:11
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