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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】请问怎样将vasp产生的电荷密度文件转化为ms的可视格式？
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grass6210

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请问怎样将vasp产生的电荷密度文件转化为ms的可视格式？

请问怎样将vasp产生的电荷密度文件转化为ms的可视格式？有没有虫子知道MS可识别的电荷密度的格式啊？谢谢
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1楼 2010-02-03 13:36:32
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grass6210

铜虫 (初入文坛)
你好，我对于MS不太熟悉，现在想利用MS画vasp得到的电荷密度，请问能告诉我关于坐标的.car文件格式和关于电荷密度的.grd文件的格式吗？不甚感激,网上找了很久了也没有找到。谢谢
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3楼2010-02-03 16:34:28
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ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
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zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-02-05 21:21
找到ms中的文件，分析一下就是了。
想办法将vasp改成那样的。
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2楼2010-02-03 14:12:53
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hookah

木虫 (正式写手)
★ ★
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ice_rain(金币+1):谢谢指导 2010-02-03 21:19
这个在materialstudio的帮助文件中有，你查一下grid格式的文件，很好转化的，不过你需要自己编写一个小程序！不难啊！
再有好像有前人写过一个转换的程序，你可以找一下！
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4楼2010-02-03 20:22:43
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gougou9991

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-02-03 14:12:53:
找到ms中的文件，分析一下就是了。
想办法将vasp改成那样的。

看了帮助文档，还不是很清楚，请指教：
(1)MS的help里面列出了一个.car文件的例子
!BIOSYM archive 3
PBC=ON

!DATE
PBC  38.58490   2.45930  16.51051  90.00000  90.00000  90.00000
C1       0.681504591    2.455258755    0.000000000 XXXX 1      xx      C   0.000
C1       2.121338199    2.455870903    0.000000000 XXXX 1      xx      C   0.000
...
end
end
但是没有对它有详细说明，不明白第六行各代表什么：
C1       0.681504591    2.455258755    0.000000000 XXXX 1      xx      C   0.000
特别是XXXX 1   xx   C  0.00是什么意思？
(2)help里面grd的例子：
DMol3 total electron density            
(1p,e12.5)  
   9.000   8.200   9.400  90.000  90.000  90.000
   45   41   47
    1  -23   22  -20   21  -22   25
0.00000E+00
0.00000E+00
.....
help里面写到“The next six integers in the fifth line indicate the number of grid spaces to the left and right of the origin in directions a, b, and c” 其中“the origin”是指的什么？是原胞中心吗？
第七行开始是具体电荷密度数值，其中第一个数值对应实空间原胞的哪一点？是原胞中心吗？电荷密度的数值是按什么规律写的？
谢谢了啊！
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5楼2010-02-05 16:06:47
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