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【求助】autodock读对接结果出错，还有对接跟那些因素有关
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ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\ViewerFramework\VF.py", line 716, in tryto File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 2840, in doit File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\Docking.py", line 74, in readDlg File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\Docking.py", line 337, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\DlgParser.py", line 106, in parse File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\DlgParser.py", line 219, in match File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\DlgParser.py", line 227, in setADVersion ValueError: invalid literal for float(): 4.2.1 是不是缺少文件了？ 还有 在用autodock做文献报道过的化合物的对接，建模来看看我们的化合物如何 但一直都没得到文献的结果 跟文献上说的不一样就是：蛋白跟配体的优化不一样，文献上的蛋白结构是经过amber优化，而配体就是在sybyl里优化的，而我那个蛋白没有用amber优化，而只是用deepview修复下，配体就用guassi优化过。 grid的大小是一样的，dock的配置也是一样的。但文献没给出grid box的坐标，我用的是原本配体的坐标。 会不会跟grid box的坐标有很大关系？还有蛋白配体之类也会不会很大关系？ 老板急着要模型啊，谢谢啊 |
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