| 查看: 322 | 回复: 0 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】autodock读对接结果出错，还有对接跟那些因素有关
|
|||
|
ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\ViewerFramework\VF.py", line 716, in tryto File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 2840, in doit File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\Docking.py", line 74, in readDlg File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\Docking.py", line 337, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\DlgParser.py", line 106, in parse File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\DlgParser.py", line 219, in match File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\DlgParser.py", line 227, in setADVersion ValueError: invalid literal for float(): 4.2.1 是不是缺少文件了？ 还有 在用autodock做文献报道过的化合物的对接，建模来看看我们的化合物如何 但一直都没得到文献的结果 跟文献上说的不一样就是：蛋白跟配体的优化不一样，文献上的蛋白结构是经过amber优化，而配体就是在sybyl里优化的，而我那个蛋白没有用amber优化，而只是用deepview修复下，配体就用guassi优化过。 grid的大小是一样的，dock的配置也是一样的。但文献没给出grid box的坐标，我用的是原本配体的坐标。 会不会跟grid box的坐标有很大关系？还有蛋白配体之类也会不会很大关系？ 老板急着要模型啊，谢谢啊 |
回复此楼» 猜你喜欢
为什么中国大学工科教授们水了那么多所谓的顶会顶刊，但还是做不出宇树机器人？
已经有9人回复
-
版面费该交吗
已经有9人回复
-
体制内长辈说体制内绝大部分一辈子在底层，如同你们一样大部分普通教师忙且收入低
已经有13人回复
-
面上可以超过30页吧？
已经有4人回复
-
“人文社科而论，许多学术研究还没有达到民国时期的水平”
已经有5人回复
-
什么是人一生最重要的？
已经有4人回复