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minmin_0082003金虫 (正式写手)
莫愁莫愁
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[交流]
【求助】怎么把MS建立的格子参数转化成siesta的格子参数（格矢)？
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我用MS建立的Au111 3X3 2层 真空层15A 后会出现一行这样的 •PBC 8.6514 8.6514 17.3546 90.0000 90.0000 120.0000 (P1) 坐标如下 •PBC 8.6514 8.6514 17.3546 90.0000 90.0000 120.0000 (P1) •Au1 0.000000000 0.000000000 2.354607603 XXXX 1 xx •Au2 1.441896793 0.832479501 -0.000000000 XXXX 1 xx •Au3 2.883793586 0.000000000 2.354607603 XXXX 1 xx •Au4 4.325690379 0.832479501 -0.000000000 XXXX 1 xx •Au5 5.767587171 -0.000000000 2.354607603 XXXX 1 xx •Au6 7.209483964 0.832479501 -0.000000000 XXXX 1 xx •Au7 -1.441896793 2.497438504 2.354607603 XXXX 1 xx •Au8 -0.000000000 3.329918006 0.000000000 XXXX 1 xx •Au9 1.441896793 2.497438504 2.354607603 XXXX 1 xx •Au10 2.883793586 3.329918006 0.000000000 XXXX 1 xx •Au11 4.325690379 2.497438504 2.354607603 XXXX 1 xx •Au12 5.767587171 3.329918006 -0.000000000 XXXX 1 xx •Au13 -2.883793586 4.994877009 2.354607603 XXXX 1 xx •Au14 -1.441896793 5.827356510 0.000000000 XXXX 1 xx •Au15 -0.000000000 4.994877009 2.354607603 XXXX 1 xx •Au16 1.441896793 5.827356510 0.000000000 XXXX 1 xx •Au17 2.883793586 4.994877009 2.354607603 XXXX 1 xx •Au18 4.325690379 5.827356510 0.000000000 XXXX 1 xx I然后把这个转化成siesta的输入文件的形式 LatticeConstant（晶格常数） 8.6514 Ang Latticeparameters（晶格参数） 1 1 2.0059 90. 90. 120. 这样听说不能正确的表达我的超胞，要转化成了晶格矢量才可以 I我试了两种 1第一种 LatticeConstant（晶格常数） 8.6514 Ang %block LatticeVectors（晶矢） -0.500000 0.866025404 0.00000000 0.0000000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 2.00598747 %endblock LatticeVectors 相对应的输出文件如下： Naive supercell factors: 3 3 2 (这个是怎么算出来的呢) Auxiliary supercell needs to be larger than naive one... *** Auxiliary supercell is more than twice as big! superc: Internal auxiliary supercell: 5 x 4 x 2 = 40 superc: Number of atoms, orbitals, and projectors: 1320 6240 16120 2) i第二种 LatticeConstant（晶格常数） 8.6514 Ang %block LatticeVectors（晶矢） 1.000000 0.000000 0.000000 -0.500000 0.866025 0.000000 0.000000 0.000000 2.00598747 %endblock LatticeVectors 对应输出文件 siesta: k-grid: Number of k-points = 13 siesta: k-grid: Cutoff (effective) = 8.677 Ang siesta: k-grid: Supercell and displacements siesta: k-grid: 5 0 0 0.000 siesta: k-grid: 0 5 0 0.000 siesta: k-grid: 0 0 1 0.000 Naive supercell factors: 3 3 2 superc: Internal auxiliary supercell: 3 x 3 x 2 = 18 superc: Number of atoms, orbitals, and projectors: 594 2808 7254 到底是怎么转化的，哪个才是正确的呢 |
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