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小虫之老虫

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎么鉴定分离的菌纯不纯?

怀疑我分离的菌可能被同一属的其它菌污染,或者当初分离的菌就不纯。
请问大家我现在怎么才能证实它是不是被污染了?
万分感谢!
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2010-01-29 12:14:33:
重新弄成单克隆然后测序

我用16s测过了,测序片段长度是430bp,测序然后BLAST显示是同一种菌,但PCR的时候有的能P出来,有的就P不出来。
把测序出来的片段用Bio Edit软件比对,差别很大,根本就不一致
测序跟它是同一种菌的同源性只有2%,而另一种测序不是同一种菌的反而同源性是91%,相同的碱基更多
6楼2010-01-29 13:25:29
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85715623

木虫 (正式写手)

小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
稀释涂布平板啊。根据菌落形态可以判断是否为同一种类。
2楼2010-01-28 21:36:36
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 85715623 at 2010-01-28 21:36:36:
稀释涂布平板啊。根据菌落形态可以判断是否为同一种类。

是同源性很近的菌
形态一样
显微镜下看不出什么的
3楼2010-01-29 12:13:43
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

重新弄成单克隆然后测序
4楼2010-01-29 12:14:33
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