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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】怎么鉴定分离的菌纯不纯？
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎么鉴定分离的菌纯不纯？

怀疑我分离的菌可能被同一属的其它菌污染，或者当初分离的菌就不纯。
请问大家我现在怎么才能证实它是不是被污染了？
万分感谢！
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1楼 2010-01-28 20:53:33
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85715623

木虫 (正式写手)
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
稀释涂布平板啊。根据菌落形态可以判断是否为同一种类。
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2楼2010-01-28 21:36:36
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 85715623 at 2010-01-28 21:36:36:
稀释涂布平板啊。根据菌落形态可以判断是否为同一种类。

是同源性很近的菌
形态一样
显微镜下看不出什么的
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3楼2010-01-29 12:13:43
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
重新弄成单克隆然后测序
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4楼2010-01-29 12:14:33
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unameder

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你分离的是细菌还是真菌？
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5楼2010-01-29 12:57:31
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2010-01-29 12:14:33:
重新弄成单克隆然后测序

我用16s测过了，测序片段长度是430bp，测序然后BLAST显示是同一种菌，但PCR的时候有的能P出来，有的就P不出来。
把测序出来的片段用Bio Edit软件比对，差别很大，根本就不一致
测序跟它是同一种菌的同源性只有2%，而另一种测序不是同一种菌的反而同源性是91%，相同的碱基更多
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6楼2010-01-29 13:25:29
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by unameder at 2010-01-29 12:57:31:
你分离的是细菌还是真菌？

细菌
乳酸菌
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7楼2010-01-29 13:26:12
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ctt1984

木虫 (正式写手)

初学者
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
序列片段太短，最好测一下全长。因为太短的片段信息量少。
再者，可以使用API 方法验证一下。
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好好做事，踏实做人！
8楼2010-01-30 11:12:39
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zjm104273

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
建议楼主取足够高的稀释度稀释涂布平板，挑取单菌落培养，也就是重新做次纯化吧
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9楼2010-01-30 11:22:58
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ctt1984 at 2010-01-30 11:12:39:
序列片段太短，最好测一下全长。因为太短的片段信息量少。
再者，可以使用API 方法验证一下。

谢谢！
祝试验顺利！
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10楼2010-01-30 12:00:41
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