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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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宏hong

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】表面能计算值为负?

我正在用Dmol3做一个氧化物的表面能,采用表面2层驰豫,
     5层结构优化后得出的total energy为-18795.187382Ha,
     3层结构优化后得出的total energy为-12429.5106102Ha,
我采用的公式如下:
                 S=[E(n)-n*Ub]/2A
                 Ub=[U(n)-U(n-2)]/2
算出的Ub=-3182.838385Ha
带入S公式,则得出E(n)-n*Ub=-18795.187382Ha-(-3182.838385Ha)*5=      -2880.995455
     很显然,算出来的结果是负的,有没有哪位大侠有相关经验的,或者知道哪错的?十分感谢了
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lfhuang

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
宏hong(金币+2):谢谢 2010-01-28 10:08
ice_rain(金币+1):谢谢讨论交流 2010-01-29 20:09
S,E(n),U(n),Ub,A都是什么?考虑全表面的自能了吗?
先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
2楼2010-01-28 10:04:28
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宏hong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lfhuang at 2010-01-28 10:04:28:
S,E(n),U(n),Ub,A都是什么?考虑全表面的自能了吗?

S是表面能,E(n)是结构优化后从out文件中找到的total energy,Ub如题中的公式,A是表面的面积。(这是我的理解)
我不知道你指的全表面的自能是指什么?因为我看文献中计算表面能时,采用的也是这个公式。
十分感谢了
3楼2010-01-28 10:08:24
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hgye

金虫 (小有名气)

宏hong(金币+5): 2010-01-28 18:09
宏hong(金币+1):我试一下,谢谢 2010-01-28 18:11
aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-01-28 19:04
原因可能是你的层数太少,计算出的Ub不准。特别是三层的模型不够,导致E(3)偏大(绝对值小),Ub的绝对值太大。
另外表面能的计算可以不这样求Ub, 直接用具有相同原子数的体材能量代替,更多的人应该是这样计算的,比你的方法计算量小,不用计算两个表面模型。你可以先这样检验一下你的结果。
4楼2010-01-28 17:45:52
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宏hong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by hgye at 2010-01-28 17:45:52:
原因可能是你的层数太少,计算出的Ub不准。特别是三层的模型不够,导致E(3)偏大(绝对值小),Ub的绝对值太大。
另外表面能的计算可以不这样求Ub, 直接用具有相同原子数的体材能量代替,更多的人应该是这样计算的 ...

恩,你说的应该是这个公式吧:
    构造一个slab,假设n个原子,计算它的能量E(n),同时计算该材料块体时单个原子对应的能量E',表面能为
                  S=(E(n)-n×Ebulk)/2s,
                  s为slab一面的面积。
     按照这个公式,Ebulk为体相能量,即从自带的structure文件中导入优化单胞后得到的数值,为Ebulk=-6365.716872Ha,其中单胞含有8个原子,切面五层超晶胞结构优化后含20个原子,5层结构优化后得出的total energy为E=-18795.187382Ha,带入公式如下:
   S=-18795.187382+(20/8)*6265.716872..........
    后面的我就不写了(不好写...),这样计算公式括号内的减法部分还是负值(-3130.8952),请问我这样计算错在哪儿了?是不是我对这个公式的理解错了?
    十分感谢!
5楼2010-01-28 20:30:45
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lfhuang

木虫 (著名写手)

宏hong(金币+3): 2010-01-29 09:33
S=(E(n)-n×Ebulk)/2s
S=-18795.187382+(20/8)*6265.716872
为什么n×Ebulk要除以8,而E(n)没有?
先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
6楼2010-01-28 20:54:18
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lfhuang

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
aylayl08(金币+3):谢谢提示 2010-01-29 09:12
宏hong(金币+2):谢谢兄台 2010-01-29 09:40
引用回帖:
Originally posted by 宏hong at 2010-01-28 10:08:24:

我不知道你指的全表面的自能是指什么?
  ...

单个原子都是有能量值的,较大SLAB和较小slab相比较时,应该还要考虑(大slab原子数目-小slab原子数目)个孤立原子的能量总合,不知道您考虑“全”了没有?
先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
7楼2010-01-28 21:00:49
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acridine

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
aylayl08(金币+3):谢谢兄台指点 2010-01-29 09:07
宏hong(金币+5): 2010-01-29 09:09
得到的数值这么大肯定是原子数目的问题了,我怀疑是不是你选择的表面模型不对,导致模型内的原子数与体材对应不上?
简单点说就是:你计算Eslab-n*Ebulk的时候,这个Eslab体系所含有的原子种类和数目是否等于n个bulk模型内的原子种类和数目?
注意原子种类也要一致,否则出现E("12个A原子+8个B原子" 的slab)-5*E("2个A原子+2个B原子" 的bulk) 这种减法,此时得到的结果是没有意义的。
原子种类和数目对应正确,仅仅原子之间结合有不同,是不会导致Eslab和n*Ebulk的总能产生如此大的差别的

[ Last edited by acridine on 2010-1-29 at 01:03 ]
8楼2010-01-29 00:57:31
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宏hong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by acridine at 2010-01-29 00:57:31:
得到的数值这么大肯定是原子数目的问题了,我怀疑是不是你选择的表面模型不对,导致模型内的原子数与体材对应不上?
简单点说就是:你计算Eslab-n*Ebulk的时候,这个Eslab体系所含有的原子种类和数目是否等于n个 ...

恩,你说的很对,原子种类确实不一样。出现了E("12个A原子+8个B原子" 的slab)-5*E("4个A原子+4个B原子" 的bulk) 。(该化合物分子式为AB)。我切完表面,并构造超晶胞后,就为12+8了,那应该怎么改?

至于你说的原子数目不一致,这在我的计算中体现出来了,即
S=-18795.187382+(20/8)*6265.716872..........
中的(20/8)。
十分感谢!
9楼2010-01-29 09:33:05
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宏hong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lfhuang at 2010-01-28 20:54:18:
S=(E(n)-n×Ebulk)/2s
S=-18795.187382+(20/8)*6265.716872
为什么n×Ebulk要除以8,而E(n)没有?

因为公式中写到了”E'为该材料块体时单个原子对应的能量“,可能我没写清楚,
E'=Ebulk/8,而Ebulk为8个原子的“共同”能量,所以公式中除以8
10楼2010-01-29 09:38:05
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