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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】如何获得FASTA格式的序列？
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yoyoyehan

[交流] 【求助/交流】如何获得FASTA格式的序列？

我想把cDNA序列翻译成多肽，要求翻译后的多肽为fas格式，请问我该怎么办呢？用到哪个软件？谢谢！
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1楼 2010-01-27 22:54:39
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anquren

金虫 (正式写手)
★ ★
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amisking(金币+1): 2010-01-29 21:18
EMBOSS swissprot网站上都有翻译程序
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2楼2010-01-28 07:41:19
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虫子火箭兵

金虫 (正式写手)
★ ★
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amisking(金币+1): 2010-01-29 21:19
NCBI上可以导出fasta格式
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3楼2010-01-28 11:13:36
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2): 2010-01-29 21:19
自己也可以编辑的，在  文本文档 里面编辑如下格式,比如 pro基因：

>pro
#######################
#######################
#######################
#######################
#######################
#######################
#######################
#################


要有>号（大于号），然后加上你的基因注释（往往是名称）。换行粘贴你的序列，

序列结束后要有一个 空格键。
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2010-01-28 11:53:17
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yoyoyehan

引用回帖:
Originally posted by 虫子火箭兵 at 2010-01-28 11:13:36:
NCBI上可以导出fasta格式

我的序列还没有提交到NCBI上，请问我怎么能得到FAS格式的？
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5楼2010-01-29 21:03:37
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地图蜗牛

银虫 (小有名气)
★
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网上也有在线转换的，搜索一下。
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6楼2010-01-30 00:29:58
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hwqstrong

金虫 (正式写手)
★
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有DNASTAR没？用他保存，然后把文件的扩展名改成FAS就OK了
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7楼2010-02-01 19:57:50
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85715623

木虫 (正式写手)
在MEGA4.0里面有格式转化啊，可以试一下，我一直在用，挺好。
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8楼2010-02-01 22:05:37
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