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yoyoyehan

[交流] 【求助/交流】如何获得FASTA格式的序列?

我想把cDNA序列翻译成多肽,要求翻译后的多肽为fas格式,请问我该怎么办呢?用到哪个软件?谢谢!
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anquren

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+1): 2010-01-29 21:18
EMBOSS swissprot网站上都有翻译程序
2楼2010-01-28 07:41:19
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虫子火箭兵

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+1): 2010-01-29 21:19
NCBI上可以导出fasta格式
3楼2010-01-28 11:13:36
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2): 2010-01-29 21:19
自己也可以编辑的,在  文本文档 里面编辑如下格式,比如 pro基因:

>pro
#######################
#######################
#######################
#######################
#######################
#######################
#######################
#################


要有>号(大于号),然后加上你的基因注释(往往是名称)。换行粘贴你的序列,

序列结束后要有一个 空格键。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2010-01-28 11:53:17
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yoyoyehan

引用回帖:
Originally posted by 虫子火箭兵 at 2010-01-28 11:13:36:
NCBI上可以导出fasta格式

我的序列还没有提交到NCBI上,请问我怎么能得到FAS格式的?
5楼2010-01-29 21:03:37
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地图蜗牛

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
网上也有在线转换的,搜索一下。
6楼2010-01-30 00:29:58
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hwqstrong

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
有DNASTAR没?用他保存,然后把文件的扩展名改成FAS就OK了
7楼2010-02-01 19:57:50
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85715623

木虫 (正式写手)

在MEGA4.0里面有格式转化啊,可以试一下,我一直在用,挺好。
8楼2010-02-01 22:05:37
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