24小时热门版块排行榜    

查看: 4818  |  回复: 26
【奖励】 本帖被评价20次,作者tephoon78增加金币 17.3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tephoon78

木虫 (正式写手)


[资源] 【原创】成功编译NBO 5.G on GAMESS (January 12, 2009 R3.)

NBO 5的源码下载
http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=12591&highlight=nbo
2009年1月的源码。
另外在厦门大学的量子化学论坛上找到的NBO 5是02年的,在链接时出错。

1.  首先确保自己会、且已编译Gamess,可以参考
http://hi.baidu.com/sobereva/blo ... 8dd04fd6887db6.html
很详细,但是有点乱。

2. 先在windows下解压,copy到linux下
3、vi nbo_5g.src
:26638  ! 到达文件的26639行
dG
:w NBO_5GA.SRC   !将nbo_5g.src的剩余内容写到一个新文件内
:q!  !不保存退出。
vi nbo_5g.src
:1   !将光标定位在第一行
:d 26638   ! 从文件的第1行到26638行全删掉
:w NBO_5GB.SRC   !将nbo_5g.src的剩余内容写到一个新文件内
:q!  !不保存退出。
注:这一步的工作是将nbo_5g.src这个文件分成2个文件NBO_5GA.SRC和NBO_5GB.SRC
4、$ifort –o enable enable.f       !编译enable.f,我用的是intel fortran 11.1
$ ./enable                      !运行enable下面是过程。
Currently supported environments:
(1) 32-bit Unix   UNIX/LINUX
(2) 64-bit Unix   UNIX/LINUX
(3) DOS           PC DOS
(4) VMS           VAX VMS

Environment to enable (1-4)? 1
Currently supported NBO versions:
(1) GEN      GENNBO  (standalone)
(2) G03      Gaussian 03
(3) G98      Gaussian 98
(4) G94      Gaussian 94
(5) GMS      GAMESS
(6) NWC      NWChem
(7) AM1      MOPAC or AMPAC

NBO Program version to enable (1-7)? 5

Module  gmsnbo.src  will be created; OK to proceed [Y]/N? Y

NBO source (NBO_5G.SRC ) contains 52194 lines of code.
A total of 44308 lines were written to  gmsnbo.src
   including 272 utility and  2 operating system dependent lines.
------
结束后产生一个gmsnbo.src文件。

5、vi gmsnbo.src
8427行 IF(MORB.EQ.0.AND.NAMEAT(IATNO(NCTR.NE.'gh') THEN
修改成 IF(MORB.EQ.0.AND.NAMEAT(IATNO(NCTR.NE.'gh'))) THEN

15421行  IF(MORB.EQ.0.AND.NAMEAT(IATNO(NCTR).NE.'gh') THEN
修改成   IF(MORB.EQ.0.AND.NAMEAT(IATNO(NCTR).NE.'gh')) THEN

6、cp gmsnbo.src ~gamess/source/
   cd ~gamess/source/
7、vi prppop.src
将1111行修改成
IF(NPROC.EQ.1) CALL RUNNBO
8、vi rhfuhf.src
1676行 插入一行:
           COMMON /ENEDA / E0
4723行在ETOT = EHF+EN行插入1行
           IF(ITER.EQ.1) E0 = ETOT

9、vi  iolib.src:  
269行      IF(LEN.LE.0           ) GO TO 810
修改成      IF(LEN.LT.0           ) GO TO 810

281行         CALL DARD(V(IS),LENW,IDAF,NSP,IDTYP)
修改成        IF(LENW .GT. 0) CALL DARD(V(IS),LENW,IDAF,NSP,IDTYP)

549行        IF (N .GT. 0 .AND. LEN .NE. IFILEN(NREC)) GO TO 800
修改成        IF (N .GT. 0 .AND. LEN .GT. IFILEN(NREC)) GO TO 800

10、cd ..
vi compall
在 265行,插入一行
           ./comp gmsnbo

11. vi lked
在 801行最后 加入 gmsnbo.o

12、./compall >& compall.log&        !重新编译gamess
13、./lked gamess 01 >& lnked.log&   !重新链接程序  01可以是其它数值
14、vi rungms
修改set VERNO=01 或你自己设置的数值。
完成。注意nbo 不能并行。

http://hi.baidu.com/quchem/blog/ ... 8c40d6a3cc2b00.html

[ Last edited by tephoon78 on 2010-1-21 at 14:40 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

物化资料综合 量化

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fooo

金虫 (正式写手)


谢谢了!
想奖励金币,该怎么操作?
引用回帖:
Originally posted by tephoon78 at 2010-1-20 16:47:
NBO 5的源码下载
http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=12591&highlight=nbo
2009年1月的源码。
另外在厦门大学的量子化学论坛上找到的NBO 5是02年的,在链接时出错。

1.  首先确保自己 ...

7楼2010-01-22 01:43:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 27 个回答

abbott

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

推荐! 不错 记录了!
2楼2010-01-20 18:49:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fooo

金虫 (正式写手)


上不去mdbbs,LZ给个源代码吧!
引用回帖:
Originally posted by tephoon78 at 2010-1-20 16:47:
NBO 5的源码下载
http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=12591&highlight=nbo
2009年1月的源码。
另外在厦门大学的量子化学论坛上找到的NBO 5是02年的,在链接时出错。

1.  首先确保自己 ...

4楼2010-01-21 03:28:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

很好很好很很好
5楼2010-01-21 16:43:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2010-01-20 20:17   回复  
 
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +13 kkkl_v 2026-08-19 13/650 2026-08-19 22:37 by 宝贝虫子
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 aOn84t7OD1JN 2026-08-19 4/200 2026-08-19 22:31 by BqkHsOAGISWU
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 PnssoZglMj3v 2026-08-19 4/200 2026-08-19 22:28 by BqkHsOAGISWU
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 PnssoZglMj3v 2026-08-19 4/200 2026-08-19 22:16 by BqkHsOAGISWU
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +12 基诺咪客 2026-08-17 16/800 2026-08-19 22:04 by kk 的小木虫
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见