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panjinbo87木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】ATK中两边电极能用不同材料做吗？
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| 请问各位大虾：在ATK中，两边电极能采用不同材料制成吗？例如左边金电极，右边铝电极。我本想先通过MS试试再输入到ATK中，但感觉挺麻烦的，而且我MS懂得也不多。希望有经验的高手不吝赐教。 |
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panjinbo87
木虫 (正式写手)
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from ATK.TwoProbe import * # Scattering elements and coordinates scattering_elements = [Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold, Gold] scattering_coordinates = [[ 0.00000000e+00, 0.00000000e+00, 7.06330299e+00], [ -1.44179070e+00, 2.49725485e+00, 7.06330299e+00], [ -2.88358140e+00, 4.99450970e+00, 7.06330299e+00], [ 2.88358140e+00, 0.00000000e+00, 7.06330299e+00], [ 1.44179070e+00, 2.49725485e+00, 7.06330299e+00], [ 0.00000000e+00, 4.99450970e+00, 7.06330299e+00], [ 5.76716280e+00, 0.00000000e+00, 7.06330299e+00], [ 4.32537222e+00, 2.49725485e+00, 7.06330299e+00], [ 2.88358140e+00, 4.99450970e+00, 7.06330299e+00], [ -2.88358140e+00, 6.65934610e+00, 9.41773796e+00], [ 0.00000000e+00, 1.66483653e+00, 9.41773796e+00], [ -1.44179070e+00, 4.16209126e+00, 9.41773796e+00], [ 1.33226763e-15, 6.65934610e+00, 9.41773796e+00], [ 2.88358140e+00, 1.66483653e+00, 9.41773796e+00], [ 1.44179070e+00, 4.16209126e+00, 9.41773796e+00], [ 2.88358140e+00, 6.65934610e+00, 9.41773796e+00], [ 5.76716280e+00, 1.66483653e+00, 9.41773796e+00], [ 4.32537222e+00, 4.16209126e+00, 9.41773796e+00], [ -2.88358140e+00, 6.65934610e+00, 1.94177389e+01], [ 0.00000000e+00, 1.66483653e+00, 1.94177389e+01], [ -1.44179070e+00, 4.16209126e+00, 1.94177389e+01], [ 1.33226763e-15, 6.65934610e+00, 1.94177389e+01], [ 2.88358140e+00, 1.66483653e+00, 1.94177389e+01], [ 1.44179070e+00, 4.16209126e+00, 1.94177389e+01], [ 2.88358140e+00, 6.65934610e+00, 1.94177389e+01], [ 5.76716280e+00, 1.66483653e+00, 1.94177389e+01], [ 4.32537222e+00, 4.16209126e+00, 1.94177389e+01], [ -1.44179070e+00, 5.82692766e+00, 2.17721732e+01], [ 1.44179070e+00, 8.32418263e-01, 2.17721732e+01], [ 0.00000000e+00, 3.32967305e+00, 2.17721732e+01], [ 1.44179070e+00, 5.82692766e+00, 2.17721732e+01], [ 4.32537222e+00, 8.32418263e-01, 2.17721732e+01], [ 2.88358140e+00, 3.32967305e+00, 2.17721732e+01], [ 4.32537222e+00, 5.82692766e+00, 2.17721732e+01], [ 7.20895386e+00, 8.32418263e-01, 2.17721732e+01], [ 5.76716280e+00, 3.32967305e+00, 2.17721732e+01]]*Angstrom electrode_elements = [Gold, Gold, Gold] electrode_coordinates = [[ 0.00000000e+00, 0.00000000e+00, 0.00000000e+00], [ 1.11022302e-16, 1.66483653e+00, 2.35443440e+00], [ 1.44179073e+00, 8.32418264e-01, 4.70886880e+00]]*Angstrom electrode_cell = [[ 2.88358145, 0. , 0. ], [-1.44179073, 2.49725479, 0. ], [ 0. , 0. , 7.06330319]]*Angstrom # Set up electrodes electrode_configuration = PeriodicAtomConfiguration( electrode_cell, electrode_elements, electrode_coordinates ) # Set up two-probe configuration twoprobe_configuration = TwoProbeConfiguration( (electrode_configuration,electrode_configuration), scattering_elements, scattering_coordinates, electrode_repetitions=[[3,3],[3,3]], equivalent_atoms=([0,0],[-1,-1]) ) 在最后两行 electrode_repetitions=[[3,3],[3,3]], equivalent_atoms=([0,0],[-1,-1]) 是什么意思啊？ |
3楼2010-01-20 15:44:25
acridine
木虫 (正式写手)
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2楼2010-01-19 00:37:06
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+3):谢谢回帖交流 2010-03-09 21:27
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+3):谢谢回帖交流 2010-03-09 21:27
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呵呵 我来回答吧 electrode_repetitions=[[3,3],[3,3]] 电极的堆积大小也就是平时文章里经常说的3x3啊或者5X5大小的电极 equivalent_atoms=([0,0],[-1,-1])这个是电极匹配时的对称原子以为输入文件只写了一个起点为零的电极元包（不信自己看），但是这个电极怎么和中间散射区的电极原子正正好好的连接呢？当然就是这个对称原子了，[0,0]是指你电极的第一个原子和中间散射区包含的电极的第一个原子正好是（XY）相同而Z相差整个元包长度这样左电极正好和中间散射区的电极连接在一起啦，[-1,-1]照此类推就是电极元包的最后一个原子和中间散射区右边的电极的最后一个原子相等，那么这个初始电极就会自动加到散射区右边形成右电极啦 不过如果是两个不同的电极，情况就麻烦了 自己摸索吧 |
4楼2010-03-09 10:40:17
5楼2010-03-09 10:44:18
