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taoran2099

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】求助荧光定量PCR实验问题

我在做荧光定量PCR实验(样品中DNA的绝对定量,SYBR Green染料法)时,遇到了一个问题:有一个基因无法定量,无论是自己构建的标准质粒还是样品,经过10倍梯度稀释后,做荧光定量时,所有的样品Ct值都集中在15附近,无法得到标准曲线。理想情况下,样品的浓度减小,Ct值应该会增大;浓度每减小10倍,Ct值应增大3.2左右。我换用反应试剂,重新配置引物后还是如此。
       后来发现我做荧光定量PCR的7个基因中(扩增产物均在250bp以下),只有这个基因选用的引物其中一条引物中有2个兼并碱基(其他6个基因的引物没有兼并碱基,都可以很好的扩增和定量)。我想问题是不是出在这里?做荧光定量PCR的引物是不是严格要求不能有兼并碱基?或是其他的原因导致无法定量?
       请高手为小弟答疑解惑,感激不尽!
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沙中清泉

木虫 (正式写手)

★ ★
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1949stone(金币+1,VIP+0): 1-16 18:03
这个情况是很奇怪哦,没遇到过,兼并碱基是什么意思
2楼2010-01-16 14:47:55
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