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【求助】请大家帮忙解决几个autodock问题
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请大家帮帮忙吧！ 1. Autodock4.0版，加氢时，是选择加所有的氢呢？或是极性氢？ 2. Docking----macromolecule---set rigid filename…选择蛋白分子后没有在屏幕上显示？这是怎么回事？ 3. 分析构象时，analyze---conformations---play后除了初始的0构象能显示，其他9个构象均无法显示。这是怎么回事？ 4. 结合吉布斯自由能与计算出的结合自由能之间存在什么关系？ |
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lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 1-14 15:29
hijing(金币+6,VIP+0): 1-15 18:45
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 1-14 15:29
hijing(金币+6,VIP+0): 1-15 18:45
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autodock的user guide里面有说明要求 1.然后网上教程也有比较具体的一下操作，上面基本都是大分子受体加极性的，小分 子全加，个人觉得这个其实也没太大所谓吧。 2. 你按一下 “N” 看看有没显示，可能没显示在屏幕中心 3.这应该不会吧？你往后点一下那个方向箭头试试 4.看着玩……具体有公式，自己找找吧。autodock也不是用来算能量的，要算能量最好用其他方法。 以上，有错的，请高手指正！ |
2楼2010-01-14 13:02:44
fmtzhangli
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5