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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

[交流] 【beefly个人文集】Gaussian-NBO产生*.31、*.47文件的一个BUG

如果基组含有g函数,那么Gaussian-NBO产生的*.31和*.47文件存在错误。以Ne原子的HF/cc-pvqz计算为例。计算完成后,打开NBO程序产生的*.47文件。在$CONTRACT部分:

第一个错误。没有对应于g函数的归一化收缩因子(CG)。仔细检查,发现打印到f函数里去了(位于CF)。

第二个错误。再找到NCOMP这行数组的最后一项,正确的话应当是9或15,分别对应球g函数或直角g函数的个数。若用原始的NBO 3.1,没有问题。如果用从源代码编译的NBO 5,这个数是7或10,真的变成f函数了。

同样,打开*.31文件。如果用NBO 3.1,那么最后一部分数据对应g函数的归一化收缩因子,你会发现都是0,g的因子错误地打印到f函数区(倒数第二部分)。如果用NBO 5,则根本没有g函数区。

因此,如果有g函数,*.31、*.47文件需要做些修改,才能用于GENNBO或用来画图。

我用pc-games和nwchem做上面的计算,一切正常。

最近读了一下NBO的源代码,发现NBO 3的$CONTRACT不支持g函数,但其它数据区可以。因此,在有g基函数的情况下,Gaussian做一般的NBO分析没问题。但是在产生.47或.31文件的时候,Gaussian的接口程序做了点小手脚,把g当作f函数输出给NBO。

接上NBO 5以后,虽然支持g函数了,但Gaussian的这段接口代码在编译的时候没改过来,所以仍然是按照f函数处理。

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:35 ]
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
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fooo

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
厉害,佩服!
引用回帖:
Originally posted by beefly at 2010-1-9 04:21:
如果基组含有g函数,那么Gaussian-NBO产生的*.31和*.47文件存在错误。以Ne原子的HF/cc-pvqz计算为例。计算完成后,打开NBO程序产生的*.47文件。在$CONTRACT部分:

第一个错误。没有对应于g函数的归一化收缩因子 ...

5楼2010-01-11 03:33:06
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tangsw911

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
高见,这都能让你发现!强!
2楼2010-01-09 09:42:25
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by beefly at 2010-1-9 04:21:
如果基组含有g函数,那么Gaussian-NBO产生的*.31和*.47文件存在错误。以Ne原子的HF/cc-pvqz计算为例。计算完成后,打开NBO程序产生的*.47文件。在$CONTRACT部分:

第一个错误。没有对应于g函数的归一化收缩因子 ...

您测试过ADF吗?
前途光明,出路难觅!
3楼2010-01-09 11:18:55
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 1-10 15:12
引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2010-1-9 11:18:


您测试过ADF吗?

ADF不用Gaussian基函数的,所以没有.31文件,.47文件也没有$CONTRACT这一部分。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2010-01-10 14:34:07
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