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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

[交流] 【beefly个人文集】Gaussian-NBO产生*.31、*.47文件的一个BUG

如果基组含有g函数，那么Gaussian-NBO产生的*.31和*.47文件存在错误。以Ne原子的HF/cc-pvqz计算为例。计算完成后，打开NBO程序产生的*.47文件。在$CONTRACT部分：

第一个错误。没有对应于g函数的归一化收缩因子（CG）。仔细检查，发现打印到f函数里去了（位于CF）。

第二个错误。再找到NCOMP这行数组的最后一项，正确的话应当是9或15，分别对应球g函数或直角g函数的个数。若用原始的NBO 3.1，没有问题。如果用从源代码编译的NBO 5，这个数是7或10，真的变成f函数了。

同样，打开*.31文件。如果用NBO 3.1，那么最后一部分数据对应g函数的归一化收缩因子，你会发现都是0，g的因子错误地打印到f函数区（倒数第二部分）。如果用NBO 5，则根本没有g函数区。

因此，如果有g函数，*.31、*.47文件需要做些修改，才能用于GENNBO或用来画图。

我用pc-games和nwchem做上面的计算，一切正常。

最近读了一下NBO的源代码，发现NBO 3的$CONTRACT不支持g函数，但其它数据区可以。因此，在有g基函数的情况下，Gaussian做一般的NBO分析没问题。但是在产生.47或.31文件的时候，Gaussian的接口程序做了点小手脚，把g当作f函数输出给NBO。

接上NBO 5以后，虽然支持g函数了，但Gaussian的这段接口代码在编译的时候没改过来，所以仍然是按照f函数处理。

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:35 ]
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
1楼 2010-01-09 04:21:19
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by beefly at 2010-1-9 04:21:
如果基组含有g函数，那么Gaussian-NBO产生的*.31和*.47文件存在错误。以Ne原子的HF/cc-pvqz计算为例。计算完成后，打开NBO程序产生的*.47文件。在$CONTRACT部分：

第一个错误。没有对应于g函数的归一化收缩因子 ...

您测试过ADF吗？
赞一下(1人) 回复此楼
前途光明，出路难觅！
3楼2010-01-09 11:18:55
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tangsw911

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
高见，这都能让你发现！强！
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-01-09 09:42:25
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 1-10 15:12
引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2010-1-9 11:18:


您测试过ADF吗？

ADF不用Gaussian基函数的，所以没有.31文件，.47文件也没有$CONTRACT这一部分。
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2010-01-10 14:34:07
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fooo

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
厉害，佩服！
引用回帖:
Originally posted by beefly at 2010-1-9 04:21:
如果基组含有g函数，那么Gaussian-NBO产生的*.31和*.47文件存在错误。以Ne原子的HF/cc-pvqz计算为例。计算完成后，打开NBO程序产生的*.47文件。在$CONTRACT部分：

第一个错误。没有对应于g函数的归一化收缩因子 ...

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5楼2010-01-11 03:33:06
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