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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】分子对接出错求解？
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ymdlove

[交流] 【求助】分子对接出错求解？

autodock4: I'm sorry; I can't find or open "Ru_3N12.maps.fld"
________________________________________________________________________________


autodock4: I'm sorry; I can't find or open "Ru_3N12.maps.fld"
Real= 0.69,  CPU= 0.11,  System= 0.02
________________________________________________________________________________

有没有高人知道我哪里出错了···由于是刚接触这个所以又很多地方都不懂
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1楼 2010-01-07 15:04:08
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ymdlove

引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2010-1-14 13:06:
试试重新处理一下受体和配体文件
我试过文件没处理好，即使Grid成功也是缺文件的，然后dock就出错了

谢谢你··问题已经解决··但是现在打不开dlg文件····
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5楼2010-01-14 14:07:51
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winterose_

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流！ 1-8 23:27
AUTOGRID运行成功了吗?
有没有生成相应的maps.fld文件?
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2楼2010-01-08 13:51:48
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ymdlove

★
zeoliters(金币+1,VIP+0):鼓励交流！ 1-8 23:28
引用回帖:
Originally posted by winterose_ at 2010-1-8 13:51:
AUTOGRID运行成功了吗?
有没有生成相应的maps.fld文件?

运行成功了，autogrid4: Successful Completion.

Grid        Atom        Minimum           Maximum
Map         Type        Energy            Energy
                (kcal/mol)        (kcal/mol)
____        ____        _____________        _____________
1         A           -0.67         2.03e+05
2         C           -0.75         2.03e+05
3         HD           -0.71         1.10e+05
4         N           -0.84         2.00e+05
5         NA           -1.12         2.00e+05
6         OA           -1.19         2.00e+05
7         SA           -0.92         2.03e+05
8         e          -27.38         1.24e+01        Electrostatic Potential
9         d            0.00         1.55e+00        Desolvation Potential


* Note:  Every pairwise-atomic interaction was clamped at 100000.00


autogrid4: Successful Completion.
Real= 5m 08.58s,  CPU= 2m 34.24s,  System= 0.58s

同时也生成了相应的配体maps.fld文件，但提示的缺少受体maps.fld文件，
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3楼2010-01-08 16:38:05
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arthurii

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 1-14 15:29
试试重新处理一下受体和配体文件
我试过文件没处理好，即使Grid成功也是缺文件的，然后dock就出错了
赞一下(10人) 回复此楼
4楼2010-01-14 13:06:55
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