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xiaoyuyxy

木虫 (正式写手)

[交流] 大家帮忙看一下这个算不算氢键(有数据)

解晶体的老师发的数据里只有两个N-H...O键,而跟这两个N原子对称的N却没有形成氢键;用platon查找后发现了很多相关氢键,那是不是其它没给的不算氢键?
1 Intra 1 N1   --H1A   ..O11   [         ]      0.92       2.43   3.139(2)        134
2 Intra 1 N1   --H1B   ..O1    [         ]      0.92       2.28   3.051(2)        141
3      1 N2   --H2A   ..O8    [  2545.01]      0.92       2.19   3.090(2)        167
4      1 N2   --H2B   ..O2    [  4555.01]      0.92       2.51   3.424(2)        171
5      1 N2   --H2B   ..O8    [  4555.01]      0.92       2.42   3.093(2)        130'        58'              359.00
6      1 N3   --H3A   ..O14   [  1545.02]      0.92       2.43   3.133(2)        134
7      1 N3   --H3A   ..O8    [  4555.01]      0.92       2.44   3.218(2)        142'        72'              348.00
8      1 N3   --H3B   ..O9    [  1545.01]      0.92       1.94   2.797(2)        155
9 Intra 1 N4   --H4A   ..O1    [         ]      0.92       2.28   3.055(2)        141
10 Intra 1 N4  --H4B   ..O11   [         ]      0.92       2.42   3.132(2)        135
11      1 N4  --H4B   ..O13   [  3666.02]      0.92       2.42   3.158(2)        137'        88'              360.00
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
按理说这些都算氢键,不过用没有用还需你自己取舍
2楼2010-01-02 23:17:48
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xiaoyuyxy

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by fmopily at 2010-1-2 23:17:
按理说这些都算氢键,不过用没有用还需你自己取舍

是啊,我也这样认为的,可解晶体的老师只给出了其中两个,不知为什么?
3楼2010-01-03 09:55:45
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