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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】怎样在linux上安装Amber10？
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vallen

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】怎样在linux上安装Amber10？

我的系统是 64位的FC10
请问应该怎么安装才好？

我开始是按说明书上写的那样安装，可是总会出一大堆错误
另外，编译器用什么好？
书上给的例子是 g95
./configure_amber -static g95
可是我用g95会出错，说找不到
换gfortran后，勉强能进行下去，可是也是有很多错误
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1楼 2009-12-30 18:31:49
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vallen

银虫 (正式写手)
谢谢，如果我要换个编译器重新装的话，怎么把原来装的卸载掉？ 是不是 ./configure 后加个clean就可以了？
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4楼2010-01-04 17:31:44
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查看全部 5 个回答

zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
zeoliters(金币+3,VIP+0):多谢回帖交流！ 1-1 14:57
没装过amber，只能给一般性的建议。g95找不到说明你的linux里面没有装。configure是在做系统的环境检查，看看必须的库，编译器等等是否存在。那么如果他找不到必须的库的话，就通不过。这样你只能把它检查说找不到的库装上。并且把路径设置好。这样一般就可以通过了。
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分子模拟的主页http://varmilion.tk/
2楼2009-12-31 18:00:11
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fantastic

银虫 (著名写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 1-4 15:21
我在red hat enterprise linux 5上面安装成功了！并行的也可以了
建议使用gcc编译器编译amberTools，Intel ifort编译amber
你可以Google搜索一下，又一些安装的教程的，amber9的也可以参考！
分子模拟论坛里面就有，好运！
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3楼2010-01-04 11:15:18
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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 1-16 13:04
引用回帖:
Originally posted by vallen at 2010-1-4 17:31:
谢谢，如果我要换个编译器重新装的话，怎么把原来装的卸载掉？ 是不是 ./configure 后加个clean就可以了？

一般机器上有f95，你建立个连接，
ln -s f95 g95
再/confiuigre g95就行了

如果出现segment fault，不用管它，接着make就行了
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技术博客：http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
5楼2010-01-16 10:02:09
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