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reasonspare

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】一个NCBI里没有的DNA几率是多少

一个NCBI里没有的DNA几率是多少

在进行植物抗病性分子标记的时候(该植物genome 已经测序完成,但是可能有些该gap没有完成),我到一个marker, 居然在在其genome database 没有,我怀疑它可能在gap中,但是总应该在NCBI中找到相似的吧,结果也没有。我怀疑它可能是污染,然而重新设计引物,却发现在该植物中有1个拷贝,

我想知道一个完全新的,在NCBI里没有相似的DNA片段的几率有多少。
这段序列有没有做下去的必要。

谢谢。
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thinka

铜虫 (著名写手)

★ ★
reasonspare(金币+1,VIP+0):谢谢 12-30 09:08
reasonspare(金币+1,VIP+0): 12-30 09:10
没看懂你说的什么
2楼2009-12-29 17:19:35
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jasco

木虫 (正式写手)


reasonspare(金币+1,VIP+0):谢谢 12-30 09:09
还是很多的,如果是研究比较少的物种就更多了
3楼2009-12-29 17:28:08
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):都不是,是木瓜 12-30 09:08
你研究的植物是什么啊,是水稻吗,还是拟南芥还是玉米啊?
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2009-12-29 21:54:56
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reasonspare

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2009-12-29 21:54:
你研究的植物是什么啊,是水稻吗,还是拟南芥还是玉米啊?

都不是,是木瓜
大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
5楼2009-12-30 09:08:25
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mhx102006

银虫 (小有名气)


司马诸葛(金币+1,VIP+0):谢谢交流 12-30 20:56
不应该的啊  木瓜的全序列都已经解析了啊
6楼2009-12-30 10:23:08
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mhx102006

银虫 (小有名气)

不应该的啊  木瓜的全序列都已经解析了啊
7楼2009-12-30 10:26:43
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):找了没有,我所在单位就是参与木瓜测序的,没有。 12-31 03:39
引用回帖:
Originally posted by mhx102006 at 2009-12-30 10:23:
不应该的啊  木瓜的全序列都已经解析了啊

那还是有可能的啊,那你可以不从NCBI里面搜索,到木瓜的测序中心去找,你到网上搜搜
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
8楼2009-12-30 21:57:18
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reasonspare

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2009-12-30 21:57:

那还是有可能的啊,那你可以不从NCBI里面搜索,到木瓜的测序中心去找,你到网上搜搜

找了没有,我所在单位就是参与木瓜测序的,没有。
大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
9楼2009-12-31 03:40:00
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匿名

用户注销 (著名写手)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):xiexie 1-5 08:09
本帖仅楼主可见
10楼2009-12-31 06:50:36
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