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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】一个NCBI里没有的DNA几率是多少
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reasonspare

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】一个NCBI里没有的DNA几率是多少

一个NCBI里没有的DNA几率是多少

在进行植物抗病性分子标记的时候(该植物genome 已经测序完成，但是可能有些该gap没有完成)，我到一个marker, 居然在在其genome database 没有，我怀疑它可能在gap中，但是总应该在NCBI中找到相似的吧，结果也没有。我怀疑它可能是污染，然而重新设计引物，却发现在该植物中有1个拷贝，

我想知道一个完全新的，在NCBI里没有相似的DNA片段的几率有多少。
这段序列有没有做下去的必要。

谢谢。
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1楼 2009-12-29 10:04:41
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thinka

铜虫 (著名写手)
★ ★
reasonspare(金币+1,VIP+0):谢谢 12-30 09:08
reasonspare(金币+1,VIP+0): 12-30 09:10
没看懂你说的什么
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2楼2009-12-29 17:19:35
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jasco

木虫 (正式写手)
★
reasonspare(金币+1,VIP+0):谢谢 12-30 09:09
还是很多的，如果是研究比较少的物种就更多了
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3楼2009-12-29 17:28:08
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):都不是，是木瓜 12-30 09:08
你研究的植物是什么啊，是水稻吗，还是拟南芥还是玉米啊？
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2009-12-29 21:54:56
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reasonspare

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2009-12-29 21:54:
你研究的植物是什么啊，是水稻吗，还是拟南芥还是玉米啊？

都不是，是木瓜
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5楼2009-12-30 09:08:25
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mhx102006

银虫 (小有名气)
★
司马诸葛(金币+1,VIP+0):谢谢交流 12-30 20:56
不应该的啊  木瓜的全序列都已经解析了啊
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6楼2009-12-30 10:23:08
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mhx102006

银虫 (小有名气)
不应该的啊  木瓜的全序列都已经解析了啊
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7楼2009-12-30 10:26:43
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):找了没有，我所在单位就是参与木瓜测序的，没有。 12-31 03:39
引用回帖:
Originally posted by mhx102006 at 2009-12-30 10:23:
不应该的啊  木瓜的全序列都已经解析了啊

那还是有可能的啊，那你可以不从NCBI里面搜索，到木瓜的测序中心去找，你到网上搜搜
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
8楼2009-12-30 21:57:18
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reasonspare

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2009-12-30 21:57:

那还是有可能的啊，那你可以不从NCBI里面搜索，到木瓜的测序中心去找，你到网上搜搜

找了没有，我所在单位就是参与木瓜测序的，没有。
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9楼2009-12-31 03:40:00
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匿名

用户注销 (著名写手)
★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):xiexie 1-5 08:09
本帖仅楼主可见
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10楼2009-12-31 06:50:36
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