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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】有关DS中整合的catalyst的问题
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lyfxie8607

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】有关DS中整合的catalyst的问题

最近发了一篇文章，被拒了，审稿人说所做的药效团没有进行Fischor‘s cross vadidation test交叉验证，不过我用的是DS中的catalyst做的，不是catalyst4.11，那在DS中怎么实现这一点呢？
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1楼 2009-12-22 18:51:03
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arthurii

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 12-23 17:59
我记得DS里面做药效团是有cost检验的啊，还不够吗？
请教一下，发的是纯药效团建立还是已经有筛选结果的？
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2楼2009-12-23 15:28:09
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lyfxie8607

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2009-12-23 15:28:
我记得DS里面做药效团是有cost检验的啊，还不够吗？
请教一下，发的是纯药效团建立还是已经有筛选结果的？

没有筛选结果，这也是一个审稿人抓住的要害。
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3楼2009-12-23 19:46:10
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arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lyfxie8607(金币+6,VIP+0): 12-25 00:00
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-25 10:34
引用回帖:
Originally posted by lyfxie8607 at 2009-12-23 19:46:


没有筛选结果，这也是一个审稿人抓住的要害。

确实挺麻烦吧，不筛点东西来测试，只用老东西检验，那得做细致一点。多重检验合理性吧，还要说明一下这个药效团的意义吧？
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4楼2009-12-24 15:45:28
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arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-25 10:35
我看过一些纯用DS做药效团的文献，很多都在后面注明是有进一步筛选的，只是不在这篇发。然后还有一些是和受体结构对比，来讨论构效关系的。不过我觉得做构效关系还是用Sybyl的方法比较容易被认可。希望以上建议有用，我也是学了不就，平时也要上课，没什么时间看。
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5楼2009-12-25 00:38:18
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