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gh8207

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】如何计算基因定位中的交换率

基因定位中要计算交换率,看文献中有关于F2群体的计算,用的是下面这个公式:
r=(N1+N2/2)/N,
请问这个公式是不是也可以用于计算BC1或BC2?如果不可以,那么BC2应该怎么计算?
谢谢!

在这里我对上述公式再进一步说明:1. 用于敏感群体(表型为隐性的群体);
2. N1表示显性亲本带型,N2表示杂合型,N隐性群体总数。
对此还有个疑问:见有些文献中的计算是r=N2/N,(N1=0),这样的结果就成了原来的二倍,很不理解,请指教!

[ Last edited by gh8207 on 2009-12-21 at 16:16 ]
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majuanjuan2596

铜虫 (初入文坛)

QTL的问题想请教

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
三个小石子(金币+1,VIP+0):感谢参与交流! 12-21 18:56
对于你提出的问题,我想是可以的。我现在正要做QTL,您能不能给说一下大概思路啊。是不是这样,首先先构建一个群体,比如F2,用亲本来筛选引物,再将F1和F2的DNA提取,进行PCR,电泳,用相关软件来构建遗传图谱,再与表型形状结合来QTL相关软件来处理。谢谢了
2楼2009-12-21 15:27:02
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gh8207

木虫 (正式写手)


三个小石子(金币+1,VIP+0):感谢参与交流! 12-21 18:56
非常感谢您的回复!
对于您提的问题的大概思路确如您所说的。另外在筛选出的亲本引物中,最好引物间隔10cM左右为好。祝顺利!
3楼2009-12-21 16:21:05
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Jack_dong

银虫 (小有名气)

★ ★
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三个小石子(金币+1,VIP+0):感谢讨论,欢迎常来理工农林版交流! 12-22 15:48
隐性遗传的, F2 只选择隐性表型吗?  r=N2/N  怎么解释?
r代表交换率, N2 表示隐性个体数,  N 表示群体总数?

如果事先已经明确为3:1分离 呢?

怎么确定?
4楼2009-12-22 15:14:59
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gh8207

木虫 (正式写手)

三个小石子(金币+0,VIP+0):点击右下角的“引用回复该贴”,他才能看到你的回复,才能与你交流。欢迎常来理工农林版! 12-23 21:20
Jack_dong 似乎误解我的意思了,并不是F2只选择隐性表型群体,而是说在计算时用的是隐性群体的数据,例如野生型AA与突变型aa,F2的比例为3:1,通过BSA法筛出候选标记,再对F2群体进行分析,计算时公式中代入的是表型为突变型的群体数据,因为在这个群体中三种带型都有可能出现。
5楼2009-12-23 21:13:57
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gh8207

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by Jack_dong at 2009-12-22 15:14:
隐性遗传的, F2 只选择隐性表型吗?  r=N2/N  怎么解释?
r代表交换率, N2 表示隐性个体数,  N 表示群体总数?

如果事先已经明确为3:1分离 呢?

怎么确定?

三个小石子(金币+0,VIP+0):点击右下角的“引用回复该贴”,他才能看到你的回复,才能与你交流。欢迎常来理工农林版! 12-23 21:20

Jack_dong 似乎误解我的意思了,并不是F2只选择隐性表型群体,而是说在计算时用的是隐性群体的数据,例如野生型AA与突变型aa,F2的比例为3:1,通过BSA法筛出候选标记,再对F2群体进行分析,计算时公式中代入的是表型为突变型的群体数据,因为在这个群体中三种带型都有可能出现。
6楼2009-12-23 22:06:41
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