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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 农林综合 » 【求助】如何计算基因定位中的交换率
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gh8207

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】如何计算基因定位中的交换率

基因定位中要计算交换率，看文献中有关于F2群体的计算，用的是下面这个公式：
r=(N1+N2/2)/N,
请问这个公式是不是也可以用于计算BC1或BC2？如果不可以，那么BC2应该怎么计算？
谢谢!

在这里我对上述公式再进一步说明：1. 用于敏感群体（表型为隐性的群体）；
2. N1表示显性亲本带型，N2表示杂合型，N隐性群体总数。
对此还有个疑问：见有些文献中的计算是r=N2/N，（N1=0），这样的结果就成了原来的二倍，很不理解，请指教！

[ Last edited by gh8207 on 2009-12-21 at 16:16 ]
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1楼 2009-12-21 14:53:53
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majuanjuan2596

铜虫 (初入文坛)

QTL的问题想请教

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
三个小石子(金币+1,VIP+0):感谢参与交流！ 12-21 18:56
对于你提出的问题，我想是可以的。我现在正要做QTL，您能不能给说一下大概思路啊。是不是这样，首先先构建一个群体，比如F2，用亲本来筛选引物，再将F1和F2的DNA提取，进行PCR，电泳，用相关软件来构建遗传图谱，再与表型形状结合来QTL相关软件来处理。谢谢了
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2楼2009-12-21 15:27:02
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gh8207

木虫 (正式写手)
★
三个小石子(金币+1,VIP+0):感谢参与交流！ 12-21 18:56
非常感谢您的回复！
对于您提的问题的大概思路确如您所说的。另外在筛选出的亲本引物中，最好引物间隔10cM左右为好。祝顺利！
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3楼2009-12-21 16:21:05
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Jack_dong

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
三个小石子(金币+1,VIP+0):感谢讨论，欢迎常来理工农林版交流！ 12-22 15:48
隐性遗传的， F2 只选择隐性表型吗？  r=N2/N  怎么解释？
r代表交换率， N2 表示隐性个体数，  N 表示群体总数？

如果事先已经明确为3：1分离 呢？

怎么确定？
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4楼2009-12-22 15:14:59
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gh8207

木虫 (正式写手)
三个小石子(金币+0,VIP+0):点击右下角的“引用回复该贴”，他才能看到你的回复，才能与你交流。欢迎常来理工农林版！ 12-23 21:20
Jack_dong 似乎误解我的意思了，并不是F2只选择隐性表型群体，而是说在计算时用的是隐性群体的数据，例如野生型AA与突变型aa，F2的比例为3：1，通过BSA法筛出候选标记，再对F2群体进行分析，计算时公式中代入的是表型为突变型的群体数据，因为在这个群体中三种带型都有可能出现。
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5楼2009-12-23 21:13:57
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gh8207

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by Jack_dong at 2009-12-22 15:14:
隐性遗传的， F2 只选择隐性表型吗？  r=N2/N  怎么解释？
r代表交换率， N2 表示隐性个体数，  N 表示群体总数？

如果事先已经明确为3：1分离 呢？

怎么确定？

三个小石子(金币+0,VIP+0):点击右下角的“引用回复该贴”，他才能看到你的回复，才能与你交流。欢迎常来理工农林版！ 12-23 21:20

Jack_dong 似乎误解我的意思了，并不是F2只选择隐性表型群体，而是说在计算时用的是隐性群体的数据，例如野生型AA与突变型aa，F2的比例为3：1，通过BSA法筛出候选标记，再对F2群体进行分析，计算时公式中代入的是表型为突变型的群体数据，因为在这个群体中三种带型都有可能出现。
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6楼2009-12-23 22:06:41
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